77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6430 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 998 aa  1985    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  51.05 
 
 		 1766 aa  932    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  41.82 
 
 		 1831 aa  422  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  43.22 
 
 		 1901 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  39.59 
 
 		 1807 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  25.26 
 
 		 1004 aa  97.8  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 		 911 aa  93.2  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.71 
 
 		 1868 aa  92  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.92 
 
 		 1443 aa  84.7  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.58 
 
 		 549 aa  80.9  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.71 
 
 		 1557 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1474 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.96 
 
 		 1067 aa  64.7  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  23.08 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  42 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  35.83 
 
 		 1308 aa  57  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  54.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 		 294 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.33 
 
 		 14916 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.88 
 
 		 851 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  50.68 
 
 		 286 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.28 
 
 		 942 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  44.32 
 
 		 264 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.6 
 
 		 2216 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.25 
 
 		 239 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411546  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.88 
 
 		 1150 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.62 
 
 		 1237 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.92 
 
 		 908 aa  51.6  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1392 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 145 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  48.21 
 
 		 179 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.05 
 
 		 1349 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.66 
 
 		 951 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31060  hypothetical protein  22.74 
 
 		 705 aa  49.3  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  54.72 
 
 		 149 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  54.72 
 
 		 149 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  32.14 
 
 		 584 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.33 
 
 		 725 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  48.08 
 
 		 262 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  48.08 
 
 		 262 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.15 
 
 		 801 aa  48.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 266 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  49.06 
 
 		 210 aa  48.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.91 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  30.95 
 
 		 573 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  48.39 
 
 		 315 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  54 
 
 		 145 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 		 959 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  54 
 
 		 145 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  48.21 
 
 		 267 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  53.85 
 
 		 184 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  50.91 
 
 		 294 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  46.38 
 
 		 293 aa  45.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 		 172 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  38.2 
 
 		 259 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 261 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  40.45 
 
 		 256 aa  45.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 181 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  44.74 
 
 		 278 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.37 
 
 		 798 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 261 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 206 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10537  predicted protein  45.45 
 
 		 125 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0914569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1200 aa  45.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 234 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.23 
 
 		 1208 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 234 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  52 
 
 		 190 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 		 130 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  49.09 
 
 		 449 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  48.08 
 
 		 255 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  38.57 
 
 		 256 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 		 263 aa  44.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 174 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.31 
 
 		 213 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  26.04 
 
 		 1186 aa  44.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5397  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1011 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>