62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0430 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  100 
 
 		 573 aa  1162    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  47.44 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  27.11 
 
 		 625 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  31.84 
 
 		 595 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  26.91 
 
 		 647 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.63 
 
 		 766 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.68 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  24.44 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  24.29 
 
 		 1335 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  26.27 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.07 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.89 
 
 		 1067 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  23.66 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.1 
 
 		 908 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.91 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  29.05 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1094 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.45 
 
 		 942 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.95 
 
 		 951 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.44 
 
 		 1148 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1065 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.91 
 
 		 887 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  25.85 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  22.63 
 
 		 1150 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  27.9 
 
 		 1349 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1483  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.91 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  27.16 
 
 		 1345 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.8 
 
 		 1086 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.43 
 
 		 1091 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.92 
 
 		 997 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 		 1004 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  27.16 
 
 		 1237 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.47 
 
 		 888 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  35.29 
 
 		 1766 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.38 
 
 		 872 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  27.47 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.07 
 
 		 1831 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.2 
 
 		 1044 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.59 
 
 		 798 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.88 
 
 		 1049 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  20.83 
 
 		 801 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.37 
 
 		 914 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  20.8 
 
 		 1201 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.29 
 
 		 951 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.69 
 
 		 2216 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  20.71 
 
 		 1106 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8620  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.2 
 
 		 1239 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00545608  normal  0.590106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.1 
 
 		 1216 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  19.36 
 
 		 953 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.46 
 
 		 1183 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.58 
 
 		 1174 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.27 
 
 		 2194 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.59 
 
 		 1901 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1581 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1080 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.35 
 
 		 1041 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.03 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1492 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.15 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  24.79 
 
 		 1742 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0626  hypothetical protein  32.23 
 
 		 896 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 		 1807 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>