More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1565 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  63.37 
 
 		 1007 aa  1032    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  46.3 
 
 		 1186 aa  722    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  48.53 
 
 		 960 aa  750    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  53.93 
 
 		 923 aa  875    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  56.83 
 
 		 1183 aa  923    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  44.64 
 
 		 1201 aa  742    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  41.22 
 
 		 1053 aa  754    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  45.57 
 
 		 1064 aa  717    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  45.53 
 
 		 1190 aa  663    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  79.34 
 
 		 1023 aa  1342    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  49.71 
 
 		 1044 aa  784    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1041 aa  2154    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  47.97 
 
 		 1049 aa  849    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  66.36 
 
 		 1049 aa  1144    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  55.08 
 
 		 1492 aa  886    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  68.72 
 
 		 1044 aa  1432    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  54.04 
 
 		 1581 aa  880    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  44.1 
 
 		 965 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1200 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  45.99 
 
 		 775 aa  225  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  30.2 
 
 		 644 aa  209  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.24 
 
 		 908 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.47 
 
 		 1067 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.54 
 
 		 949 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.12 
 
 		 1148 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.25 
 
 		 1086 aa  108  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  23.23 
 
 		 953 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.99 
 
 		 762 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.99 
 
 		 762 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1080 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.63 
 
 		 1237 aa  107  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.91 
 
 		 805 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.87 
 
 		 997 aa  103  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25 
 
 		 2216 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 1818 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25.72 
 
 		 766 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25 
 
 		 951 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.62 
 
 		 951 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.73 
 
 		 888 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.43 
 
 		 1345 aa  98.2  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  22.11 
 
 		 957 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.14 
 
 		 818 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.53 
 
 		 1349 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.51 
 
 		 942 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.84 
 
 		 887 aa  94.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.08 
 
 		 751 aa  93.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.77 
 
 		 614 aa  92.8  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.34 
 
 		 1216 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.21 
 
 		 783 aa  91.3  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.22 
 
 		 1339 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  25.45 
 
 		 801 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  35.84 
 
 		 251 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.32 
 
 		 437 aa  87  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.61 
 
 		 1091 aa  86.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.52 
 
 		 1004 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.55 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  33.68 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  32.49 
 
 		 819 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.78 
 
 		 2194 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.04 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.26 
 
 		 798 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  25.29 
 
 		 1002 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  29.8 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  25.07 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  27.74 
 
 		 344 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  25.06 
 
 		 1150 aa  81.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  38.52 
 
 		 263 aa  80.9  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.82 
 
 		 1742 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.31 
 
 		 649 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  26.21 
 
 		 852 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  27.18 
 
 		 292 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1196 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  32.77 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  25.09 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.03 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  26.65 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 416 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.91 
 
 		 416 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.25 
 
 		 325 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.12 
 
 		 892 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  38.66 
 
 		 338 aa  77  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.33 
 
 		 554 aa  77  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  26.37 
 
 		 570 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  25.84 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  25.06 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.73 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24.26 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  27.11 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  34.46 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.78 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  31.43 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  26.04 
 
 		 303 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  26.78 
 
 		 312 aa  74.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  32.2 
 
 		 327 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  23.71 
 
 		 433 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.73 
 
 		 348 aa  74.3  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  26.62 
 
 		 437 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  25.08 
 
 		 319 aa  74.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>