More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1562 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  68.72 
 
 		 1041 aa  1430    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  41.37 
 
 		 1053 aa  736    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  47.24 
 
 		 960 aa  713    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  51.36 
 
 		 923 aa  804    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  57.21 
 
 		 1007 aa  901    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  45.1 
 
 		 1186 aa  707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  39.32 
 
 		 1064 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  54.49 
 
 		 1183 aa  881    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  43.79 
 
 		 1201 aa  711    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1044 aa  2159    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  50.11 
 
 		 1049 aa  784    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.64 
 
 		 1044 aa  745    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  53.25 
 
 		 1492 aa  860    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  70.01 
 
 		 1023 aa  1174    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  51.6 
 
 		 1581 aa  830    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  59.28 
 
 		 1049 aa  1004    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  43.76 
 
 		 1190 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  44.55 
 
 		 965 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1200 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  47.51 
 
 		 775 aa  230  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  30.31 
 
 		 644 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.61 
 
 		 1067 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.63 
 
 		 997 aa  125  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.12 
 
 		 908 aa  125  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.18 
 
 		 1148 aa  118  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.09 
 
 		 762 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.09 
 
 		 762 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  25.85 
 
 		 957 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.49 
 
 		 2216 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 1818 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.33 
 
 		 949 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.78 
 
 		 805 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  38.73 
 
 		 251 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  23.4 
 
 		 818 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.18 
 
 		 953 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.17 
 
 		 888 aa  99.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.87 
 
 		 614 aa  98.6  6e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.03 
 
 		 887 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.46 
 
 		 1091 aa  92.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  36.42 
 
 		 253 aa  92  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.13 
 
 		 1349 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.54 
 
 		 801 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.47 
 
 		 1345 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  26.28 
 
 		 1002 aa  88.2  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.35 
 
 		 951 aa  87.8  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32 
 
 		 444 aa  87.8  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.07 
 
 		 766 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  31.61 
 
 		 819 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.09 
 
 		 951 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.28 
 
 		 1004 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  28.27 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.5 
 
 		 649 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  24.32 
 
 		 1339 aa  84.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.57 
 
 		 798 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.25 
 
 		 444 aa  84.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.4 
 
 		 942 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 		 554 aa  84  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  30.85 
 
 		 273 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  22.73 
 
 		 1237 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.9 
 
 		 1150 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.54 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.59 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 1392 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.95 
 
 		 2194 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  29.83 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.56 
 
 		 725 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  30.39 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.81 
 
 		 1086 aa  82  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25.07 
 
 		 1216 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.01 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  32.46 
 
 		 487 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.36 
 
 		 348 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.72 
 
 		 447 aa  81.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  32.18 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.36 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.2 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.36 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 842 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.9 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.85 
 
 		 654 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.53 
 
 		 911 aa  78.2  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.38 
 
 		 291 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 416 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  25.73 
 
 		 751 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1080 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  29.78 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.76 
 
 		 416 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.64 
 
 		 586 aa  77  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  30.98 
 
 		 433 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 442 aa  77  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.46 
 
 		 892 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  29.47 
 
 		 852 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  31.21 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.87 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  37.01 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.61 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  30.51 
 
 		 766 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 621 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.1 
 
 		 267 aa  73.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>