73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1602 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  100 
 
 		 1002 aa  1951    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.93 
 
 		 1216 aa  126  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.88 
 
 		 1148 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1080 aa  108  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  25.98 
 
 		 1049 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  23.19 
 
 		 1190 aa  108  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  28.01 
 
 		 1150 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.91 
 
 		 725 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.81 
 
 		 649 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  28.05 
 
 		 2216 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.02 
 
 		 1349 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  21.85 
 
 		 783 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.2 
 
 		 1004 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.74 
 
 		 1044 aa  97.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  24.58 
 
 		 1186 aa  97.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.48 
 
 		 798 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.95 
 
 		 908 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  25.14 
 
 		 1267 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.46 
 
 		 1067 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  22 
 
 		 1345 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  24.12 
 
 		 923 aa  96.3  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  22.99 
 
 		 773 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.61 
 
 		 1053 aa  94.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.68 
 
 		 942 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  26.12 
 
 		 1064 aa  94  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.09 
 
 		 805 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.02 
 
 		 911 aa  92  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.11 
 
 		 951 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.62 
 
 		 1742 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.24 
 
 		 2194 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.28 
 
 		 1044 aa  90.1  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.58 
 
 		 888 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  22.2 
 
 		 766 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.22 
 
 		 801 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  24.01 
 
 		 1339 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.86 
 
 		 1023 aa  89  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.23 
 
 		 1237 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  25.38 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  30.04 
 
 		 951 aa  84.7  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.78 
 
 		 570 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.29 
 
 		 1041 aa  82.4  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.95 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.23 
 
 		 997 aa  82  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  26.11 
 
 		 953 aa  81.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  25.62 
 
 		 949 aa  79.7  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  22.61 
 
 		 1049 aa  79  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  23.06 
 
 		 960 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.65 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.65 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.9 
 
 		 944 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.16 
 
 		 1183 aa  75.1  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.76 
 
 		 887 aa  75.1  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  22.96 
 
 		 965 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  24.83 
 
 		 1201 aa  73.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.06 
 
 		 1475 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  24.2 
 
 		 1818 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.78 
 
 		 1086 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  31.94 
 
 		 969 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1492 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.21 
 
 		 1091 aa  65.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.75 
 
 		 852 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  22.75 
 
 		 1007 aa  62.4  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1581 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  21.73 
 
 		 1282 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0460  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.81 
 
 		 1729 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832377  normal  0.0598199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  26.15 
 
 		 1335 aa  58.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1200 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.36 
 
 		 1174 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.94 
 
 		 1330 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.71 
 
 		 872 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.04 
 
 		 914 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  24.71 
 
 		 1073 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  29.06 
 
 		 1106 aa  44.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>