44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1598 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1313    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 		 1186 aa  220  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  32.34 
 
 		 1049 aa  219  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.38 
 
 		 1044 aa  213  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  33.94 
 
 		 1201 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.2 
 
 		 1041 aa  209  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.54 
 
 		 1183 aa  208  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  32.33 
 
 		 1053 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1492 aa  207  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 		 1007 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  26.69 
 
 		 923 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.58 
 
 		 1023 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1581 aa  197  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  30.34 
 
 		 1064 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  28.8 
 
 		 1049 aa  187  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  27.69 
 
 		 965 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.31 
 
 		 1044 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  28.03 
 
 		 1190 aa  174  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  27.09 
 
 		 960 aa  150  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1200 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.08 
 
 		 1067 aa  90.9  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.28 
 
 		 908 aa  75.5  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  22.55 
 
 		 818 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.66 
 
 		 887 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.92 
 
 		 997 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.74 
 
 		 911 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.64 
 
 		 888 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  22.55 
 
 		 1148 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.68 
 
 		 1091 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.93 
 
 		 1086 aa  64.7  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  22.13 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1080 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.39 
 
 		 762 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.39 
 
 		 762 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.68 
 
 		 2216 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  27.17 
 
 		 766 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  23.17 
 
 		 1237 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.76 
 
 		 725 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  23.22 
 
 		 1150 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  21.13 
 
 		 1349 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  20.44 
 
 		 1339 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  20.42 
 
 		 1345 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.92 
 
 		 805 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  26.34 
 
 		 1106 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>