More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0364 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  48.29 
 
 		 1041 aa  765    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  47.38 
 
 		 1183 aa  762    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  48.2 
 
 		 1007 aa  743    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  100 
 
 		 960 aa  1989    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  49.66 
 
 		 923 aa  808    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  44.63 
 
 		 1190 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  43.24 
 
 		 1186 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.99 
 
 		 1044 aa  727    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  51.42 
 
 		 1049 aa  819    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  43.49 
 
 		 1053 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  50.17 
 
 		 1023 aa  799    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  42.18 
 
 		 1064 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  47.44 
 
 		 1049 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.45 
 
 		 1044 aa  676    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  49.14 
 
 		 1492 aa  800    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  48.25 
 
 		 1581 aa  740    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  41.08 
 
 		 1201 aa  628  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  43.35 
 
 		 965 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.49 
 
 		 1200 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  42.25 
 
 		 775 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  26.69 
 
 		 644 aa  163  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  29.28 
 
 		 818 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.99 
 
 		 997 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.46 
 
 		 1067 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 		 1818 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  43.53 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.62 
 
 		 908 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  25.44 
 
 		 957 aa  108  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.39 
 
 		 1148 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.93 
 
 		 1004 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.18 
 
 		 798 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  39.66 
 
 		 253 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.72 
 
 		 888 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  37.93 
 
 		 444 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1080 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.57 
 
 		 614 aa  102  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.76 
 
 		 293 aa  102  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.64 
 
 		 951 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  101  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  30.38 
 
 		 1237 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  27.48 
 
 		 773 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  24.58 
 
 		 1345 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24 
 
 		 887 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 		 273 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  36.78 
 
 		 444 aa  99.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  24.04 
 
 		 1349 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.35 
 
 		 1150 aa  96.3  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.03 
 
 		 805 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  37.58 
 
 		 417 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  23.42 
 
 		 1339 aa  95.5  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  31.23 
 
 		 506 aa  94.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.89 
 
 		 2216 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.46 
 
 		 649 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  35.84 
 
 		 468 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  40.25 
 
 		 416 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.25 
 
 		 416 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 		 1392 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  35.47 
 
 		 442 aa  92.8  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  29.55 
 
 		 892 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.16 
 
 		 2194 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  35.43 
 
 		 487 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.66 
 
 		 766 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  29.28 
 
 		 433 aa  91.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  32.77 
 
 		 447 aa  91.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.94 
 
 		 762 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  26.46 
 
 		 781 aa  91.3  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.94 
 
 		 762 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 		 308 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  34.36 
 
 		 491 aa  90.5  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.19 
 
 		 766 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25.84 
 
 		 1216 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 		 538 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  29.43 
 
 		 852 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  37.99 
 
 		 263 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.62 
 
 		 751 aa  89.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.53 
 
 		 437 aa  89  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  29.47 
 
 		 436 aa  88.6  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  32.18 
 
 		 442 aa  88.6  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  33.85 
 
 		 464 aa  88.6  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.32 
 
 		 783 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.86 
 
 		 725 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  23.27 
 
 		 1002 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  35.75 
 
 		 277 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  48.98 
 
 		 304 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  33.48 
 
 		 1104 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  31.94 
 
 		 446 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  26.5 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.9 
 
 		 325 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  29.46 
 
 		 344 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.63 
 
 		 942 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  34.46 
 
 		 444 aa  86.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.21 
 
 		 911 aa  85.9  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  35.08 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35 
 
 		 554 aa  85.5  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.77 
 
 		 819 aa  85.1  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  30.74 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.24 
 
 		 1091 aa  84.7  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  22.48 
 
 		 1742 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  22.78 
 
 		 1267 aa  84.3  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  33.53 
 
 		 263 aa  84.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>