More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1853 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  70.09 
 
 
454 aa  679    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  958    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  66.44 
 
 
458 aa  598  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  40.82 
 
 
427 aa  326  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  36.34 
 
 
491 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  47.81 
 
 
455 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  49.78 
 
 
344 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  53.57 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  51.35 
 
 
377 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  46.08 
 
 
369 aa  195  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  36.7 
 
 
396 aa  143  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  33.1 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  31.15 
 
 
420 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  31.43 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  32.5 
 
 
548 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  37.89 
 
 
259 aa  99.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
308 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  32.79 
 
 
319 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  33.86 
 
 
312 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30.52 
 
 
277 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  35.44 
 
 
965 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  43.7 
 
 
532 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.76 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  34.08 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  33.85 
 
 
960 aa  88.2  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.88 
 
 
751 aa  86.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  32.85 
 
 
301 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.5 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
367 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  34.03 
 
 
1049 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  29.55 
 
 
1492 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.83 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  35.68 
 
 
1049 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 
1186 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.5 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  48.15 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  34.92 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.11 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 
1007 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  32.02 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  32.7 
 
 
390 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  30.81 
 
 
332 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
319 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.74 
 
 
319 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  30.84 
 
 
301 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  32.61 
 
 
923 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.25 
 
 
1200 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  31.31 
 
 
331 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.7 
 
 
1911 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.68 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  32.65 
 
 
263 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  33.99 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
1818 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  34.87 
 
 
291 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 
775 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  31.86 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  31.19 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
861 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.48 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.45 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  34.01 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  31.02 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  35.11 
 
 
1581 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  33.5 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  29.89 
 
 
291 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
509 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  35.16 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.08 
 
 
292 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  34.57 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.31 
 
 
742 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  34.03 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  30.88 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 
517 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  31.66 
 
 
384 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  30.89 
 
 
292 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  30.37 
 
 
296 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  32.31 
 
 
586 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  29.09 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  34.15 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  31.51 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.31 
 
 
826 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  33.95 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  31.51 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  30.85 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  33.84 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  31.52 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  31.19 
 
 
957 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
882 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 
349 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  31.31 
 
 
351 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
375 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  32.98 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  30.39 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  32.24 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>