More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0125 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  69.4 
 
 		 852 aa  987    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 781 aa  1563    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  34.93 
 
 		 442 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  41.41 
 
 		 303 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  34.8 
 
 		 444 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  34.07 
 
 		 444 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  33.23 
 
 		 327 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  31.15 
 
 		 957 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  28.92 
 
 		 436 aa  115  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  36.15 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.97 
 
 		 468 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  33.85 
 
 		 327 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  33.85 
 
 		 327 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  33.85 
 
 		 327 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31.13 
 
 		 433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  32.62 
 
 		 329 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 		 1818 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.21 
 
 		 437 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.94 
 
 		 412 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 		 447 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.02 
 
 		 439 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  32.44 
 
 		 417 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1080 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  30.25 
 
 		 263 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  30.67 
 
 		 437 aa  108  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.86 
 
 		 446 aa  108  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 311 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  36.15 
 
 		 253 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 		 273 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  26.61 
 
 		 416 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 		 416 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  38.16 
 
 		 1392 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 621 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  31.4 
 
 		 766 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.43 
 
 		 820 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  33.58 
 
 		 442 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  31 
 
 		 436 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  31 
 
 		 436 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  31 
 
 		 436 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  22.53 
 
 		 923 aa  97.8  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  30.65 
 
 		 312 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  31.25 
 
 		 506 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  29.81 
 
 		 603 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 620 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 		 740 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  30.07 
 
 		 636 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1581 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 1049 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  30.27 
 
 		 448 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  22.98 
 
 		 960 aa  92.4  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  30.15 
 
 		 487 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 637 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.04 
 
 		 1023 aa  91.3  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.66 
 
 		 949 aa  91.3  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  28.69 
 
 		 929 aa  90.9  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.11 
 
 		 446 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 		 446 aa  90.9  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  30.38 
 
 		 429 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 		 1007 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  29.45 
 
 		 892 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 		 882 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 		 842 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.02 
 
 		 614 aa  89  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.68 
 
 		 654 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 		 1104 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 		 267 aa  88.6  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  28.16 
 
 		 538 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.84 
 
 		 925 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  34.69 
 
 		 775 aa  87.4  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  33.66 
 
 		 1186 aa  87.4  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  24.18 
 
 		 951 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.69 
 
 		 287 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  32.52 
 
 		 1049 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  29.89 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.94 
 
 		 510 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  29.26 
 
 		 664 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  33.84 
 
 		 1064 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.57 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  28.84 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.7 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.79 
 
 		 1183 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1200 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  32.74 
 
 		 1053 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  30.08 
 
 		 262 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  29.8 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 		 1132 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  31.71 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.99 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  28.3 
 
 		 877 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  31.79 
 
 		 965 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30.74 
 
 		 277 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  39.85 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1911 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 555 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.17 
 
 		 781 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>