More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0288 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  100 
 
 		 491 aa  1023    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  37.17 
 
 		 427 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  38.12 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  37.21 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  35.68 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  43.18 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  42.63 
 
 		 344 aa  210  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  45.25 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  43.64 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  42.4 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  35.88 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  31.4 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  30.9 
 
 		 420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  28.79 
 
 		 395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  26.05 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.87 
 
 		 367 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.7 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  36.55 
 
 		 286 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  38 
 
 		 349 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  36.98 
 
 		 291 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  38 
 
 		 325 aa  97.1  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  35.64 
 
 		 330 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  37.44 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.11 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 		 348 aa  94.7  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  32.69 
 
 		 384 aa  93.6  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  36.84 
 
 		 267 aa  93.6  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.29 
 
 		 751 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  34.18 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  36.46 
 
 		 826 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 319 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  36.08 
 
 		 1186 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.31 
 
 		 351 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  34.36 
 
 		 960 aa  90.5  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 308 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 532 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.1 
 
 		 358 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  40.8 
 
 		 566 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  40.65 
 
 		 291 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  34.21 
 
 		 1049 aa  88.2  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  34.93 
 
 		 287 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  40.65 
 
 		 291 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 		 301 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.95 
 
 		 586 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  33.98 
 
 		 322 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 		 334 aa  87  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  32.29 
 
 		 426 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  34.38 
 
 		 299 aa  87.4  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 319 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  35.23 
 
 		 319 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  34.21 
 
 		 1007 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  34.21 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  34.01 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  33.85 
 
 		 290 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  33.85 
 
 		 290 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  33.85 
 
 		 290 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  33.68 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.53 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.51 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.16 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  32.98 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  32.37 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.91 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  31.86 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.51 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.55 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.04 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1581 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.11 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  31.52 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  41.27 
 
 		 548 aa  84  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  31.13 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  33.16 
 
 		 654 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 1818 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  31.79 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 300 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  29.22 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.11 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  32.47 
 
 		 628 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.3 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  31.28 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  32.12 
 
 		 965 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  32.11 
 
 		 922 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.66 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  29.05 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  33.02 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  34.02 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.63 
 
 		 616 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.05 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1200 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  31.63 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  31.71 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  31.22 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>