More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2915 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 356 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  73.48 
 
 		 377 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  56.42 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  43.99 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  52.53 
 
 		 427 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  53.27 
 
 		 454 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  53.57 
 
 		 464 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  48.28 
 
 		 458 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  49.54 
 
 		 455 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 491 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  33.73 
 
 		 420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  34.18 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  32.3 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  32.23 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 		 510 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  32.49 
 
 		 548 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  31.83 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 367 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  29.31 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  31.21 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  29.91 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  29.91 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  29.88 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  28.8 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 		 324 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  28.98 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  28.49 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  27.95 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  30.35 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  30.09 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  28.82 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  27.9 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  31.31 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.99 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1911 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  29.01 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.71 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  27.38 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  27.89 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  29.15 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  28.79 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.59 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.44 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.13 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  29.27 
 
 		 310 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  29.21 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  30.98 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.05 
 
 		 826 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  30.98 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  30.49 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 554 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  29.05 
 
 		 306 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  35.06 
 
 		 566 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  28.9 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  29.05 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  36.49 
 
 		 563 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  29.07 
 
 		 286 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  29.93 
 
 		 295 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 		 532 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  30.86 
 
 		 311 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.71 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 517 aa  92.8  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.67 
 
 		 614 aa  92  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  28.13 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  28.19 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  27.22 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  28.96 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  29.19 
 
 		 301 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 		 1053 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  25.56 
 
 		 664 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  26.67 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  25.62 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  29.51 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  27.68 
 
 		 742 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 861 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  28.88 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  27.53 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.01 
 
 		 751 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  26.58 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  29.62 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  28.17 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  28.48 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  27.81 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  27.36 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>