More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2936 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  89.29 
 
 		 311 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  65.1 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  59.27 
 
 		 337 aa  354  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  57.37 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  58.61 
 
 		 306 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  59.74 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  58.17 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  56.51 
 
 		 319 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  54.86 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  57.14 
 
 		 301 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  57.76 
 
 		 307 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  57.38 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  57.94 
 
 		 325 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  57.76 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  55.96 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  55.96 
 
 		 304 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  55.12 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  56.72 
 
 		 317 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  51.8 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  54.64 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  53.35 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  55.33 
 
 		 294 aa  298  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  50.15 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  52.58 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  53.06 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  54.3 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  53.74 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  52.36 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  52.36 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  52.36 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  54.64 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  54.64 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  49.16 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  52.2 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  49.02 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  48.33 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  47.64 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  48.31 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.25 
 
 		 367 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  46.67 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  43.45 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  46.67 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  46.1 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  47.47 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  46.18 
 
 		 390 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  45.57 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  46.2 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  47.14 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  52.68 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  44.78 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  44.27 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  46.2 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 		 349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.15 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  45.39 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  48.81 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  45.08 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  46.15 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  42.95 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  43.55 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  42.36 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  43.09 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  42.95 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  41.77 
 
 		 349 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  42 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.86 
 
 		 319 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  41.47 
 
 		 352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  40.19 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  42.54 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  39.71 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  34.25 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.79 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.91 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31.13 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.33 
 
 		 742 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.13 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.81 
 
 		 751 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.68 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  31.99 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.21 
 
 		 826 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.48 
 
 		 586 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.96 
 
 		 614 aa  93.6  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 829 aa  93.2  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.61 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 		 517 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  33.91 
 
 		 605 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  28.31 
 
 		 481 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.16 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 		 1818 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  31.7 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  30.06 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  30.25 
 
 		 556 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  28.94 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>