More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0229 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 351 aa  717    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  52.33 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.05 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  45.77 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  41.89 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  44.72 
 
 		 312 aa  212  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.9 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  42.52 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  42.47 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  45.49 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  37.54 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  40.96 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  40.99 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  41.03 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  43.26 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  41.72 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  39.61 
 
 		 421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  39.61 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  39.66 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  38.08 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  39.1 
 
 		 390 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  39.58 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  38.99 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  38.97 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  38.39 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  39.16 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  41.9 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  41.94 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  38.06 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  41.73 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  37.37 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  38.97 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  40.66 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  41.58 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  37.29 
 
 		 358 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  41.58 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  42.21 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  39.01 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  42.21 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  38.03 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  36.62 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  41.13 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  38.28 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  40.07 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  43.62 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  39.36 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  43.62 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  37.74 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  41.84 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  41.79 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  40.62 
 
 		 324 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  38.81 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  38.64 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  35.69 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  40.28 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  38.96 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  38.65 
 
 		 311 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  36.36 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  36.27 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  41.38 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  40.43 
 
 		 290 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  36.59 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  35.84 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  38.81 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  37.63 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  37.63 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  38.52 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  38.22 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  37.31 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  37.28 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  34.43 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  35.61 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.93 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  34.2 
 
 		 826 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.96 
 
 		 517 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.33 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.42 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.21 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  30.38 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.9 
 
 		 586 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  31.93 
 
 		 437 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  28.76 
 
 		 742 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  43.7 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1818 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  32.56 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.27 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  29.29 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.58 
 
 		 751 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  32.59 
 
 		 819 aa  92.8  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 		 442 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  34.16 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 		 829 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  32.8 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>