More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4691 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  66.67 
 
 
324 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  64.33 
 
 
307 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  63.91 
 
 
334 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  64.24 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  63.49 
 
 
319 aa  397  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  64.9 
 
 
325 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  62.17 
 
 
304 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  60.6 
 
 
325 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  58.94 
 
 
301 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  59.14 
 
 
327 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  60.07 
 
 
310 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  58.94 
 
 
322 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  62.05 
 
 
317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  58.88 
 
 
315 aa  353  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  58.67 
 
 
332 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  58.61 
 
 
308 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  59.74 
 
 
311 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  58.75 
 
 
324 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  56.35 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  56.62 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  54.43 
 
 
337 aa  308  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  49.85 
 
 
329 aa  298  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  51.97 
 
 
330 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  52.65 
 
 
299 aa  292  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  52.82 
 
 
299 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  52.65 
 
 
295 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  52.65 
 
 
336 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  51.47 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  51.82 
 
 
291 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  52.15 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  52.16 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  44.13 
 
 
384 aa  282  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  48.56 
 
 
338 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  51.64 
 
 
290 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  51.64 
 
 
290 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  51.64 
 
 
290 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  51.64 
 
 
351 aa  275  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  48.1 
 
 
384 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  52 
 
 
290 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  47.32 
 
 
408 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  47.68 
 
 
358 aa  272  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  52.16 
 
 
291 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  52.16 
 
 
291 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  46.39 
 
 
409 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  47.9 
 
 
287 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  53.82 
 
 
306 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  46.71 
 
 
421 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  46.71 
 
 
377 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  45.86 
 
 
390 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  48.1 
 
 
375 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  46.84 
 
 
351 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.37 
 
 
349 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  47.51 
 
 
318 aa  255  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  46.75 
 
 
312 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.89 
 
 
303 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  45.33 
 
 
309 aa  222  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  43.93 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  44.62 
 
 
301 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  43.83 
 
 
319 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  43 
 
 
308 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
319 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  41.94 
 
 
349 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  41.94 
 
 
349 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  41.61 
 
 
349 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  41.69 
 
 
347 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  41.29 
 
 
349 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  40.97 
 
 
361 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  40.97 
 
 
349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  38.31 
 
 
352 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  41.9 
 
 
351 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  38.54 
 
 
330 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  41.28 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  32.84 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.23 
 
 
433 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  32.65 
 
 
481 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.69 
 
 
325 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.48 
 
 
510 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  35.8 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.45 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.39 
 
 
751 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
621 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.96 
 
 
439 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.04 
 
 
742 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  33.78 
 
 
259 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.13 
 
 
377 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  29.05 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  27.64 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.2 
 
 
829 aa  95.5  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
554 aa  95.9  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
861 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.39 
 
 
586 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.92 
 
 
614 aa  93.6  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.36 
 
 
826 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.67 
 
 
398 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 
517 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.57 
 
 
538 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>