More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5208 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  99.73 
 
 
421 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  69.36 
 
 
384 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  64.77 
 
 
409 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  66.31 
 
 
390 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  70.52 
 
 
408 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  66.07 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.62 
 
 
367 aa  338  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  50.59 
 
 
338 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.84 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  47.09 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  45.25 
 
 
351 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  48.89 
 
 
301 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  49.06 
 
 
358 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  47.83 
 
 
332 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  48.77 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  48.44 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  49.06 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  47.78 
 
 
319 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  50.79 
 
 
291 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  48.58 
 
 
341 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  48.6 
 
 
307 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  49.05 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  46.56 
 
 
334 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  48.74 
 
 
315 aa  272  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  48.26 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  49.21 
 
 
295 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  44.96 
 
 
327 aa  269  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  48.92 
 
 
325 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  47.17 
 
 
310 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  50 
 
 
337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  46.67 
 
 
308 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  46.71 
 
 
306 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  45.14 
 
 
331 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  50.63 
 
 
291 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  50.63 
 
 
291 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  47.98 
 
 
351 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  41.79 
 
 
330 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  47.47 
 
 
300 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  45.96 
 
 
322 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  46.88 
 
 
291 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  46.42 
 
 
299 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  47.04 
 
 
336 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
303 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  46.56 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  46.18 
 
 
299 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  46.86 
 
 
290 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  46.86 
 
 
290 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  46.54 
 
 
290 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  44.81 
 
 
329 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  49.04 
 
 
306 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  44.55 
 
 
317 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.16 
 
 
308 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  46.37 
 
 
294 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  45.25 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  40.52 
 
 
312 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  47.63 
 
 
290 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  42.41 
 
 
287 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.12 
 
 
319 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  39.88 
 
 
303 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  39.94 
 
 
318 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  40.06 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  36.94 
 
 
309 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
319 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.31 
 
 
347 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  39.61 
 
 
351 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
361 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  38.36 
 
 
349 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  38.36 
 
 
349 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  38.68 
 
 
349 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  38.36 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  38.36 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  36.78 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  41.24 
 
 
259 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  33.97 
 
 
330 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.06 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.18 
 
 
325 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.62 
 
 
751 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32.53 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  32.17 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  29.82 
 
 
338 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.6 
 
 
614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  33.72 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.36 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.31 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 
356 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.15 
 
 
826 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  27.66 
 
 
1911 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.53 
 
 
586 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
416 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  30.65 
 
 
742 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  29.97 
 
 
416 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.32 
 
 
517 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.88 
 
 
292 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  28.09 
 
 
369 aa  104  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.12 
 
 
348 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  31.68 
 
 
481 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.27 
 
 
412 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.76 
 
 
829 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.15 
 
 
348 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>