More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4568 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  794    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  79.51 
 
 
409 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  75.27 
 
 
384 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  80.24 
 
 
408 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  70.62 
 
 
421 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  70.62 
 
 
377 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  67.16 
 
 
375 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.79 
 
 
367 aa  335  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  51.4 
 
 
338 aa  322  8e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  46.26 
 
 
384 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  49.68 
 
 
301 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  47.48 
 
 
351 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  49.1 
 
 
324 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  50.63 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  48.29 
 
 
334 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  49.22 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  47.17 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  50.79 
 
 
337 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  47.15 
 
 
332 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  47.8 
 
 
337 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  48.11 
 
 
307 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  48.44 
 
 
327 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  46.73 
 
 
319 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  46.89 
 
 
341 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  48.25 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  48.12 
 
 
315 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  46.92 
 
 
341 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  48.73 
 
 
295 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  47.78 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  47.02 
 
 
310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  44.51 
 
 
331 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  45.86 
 
 
306 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  46.18 
 
 
308 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  44.14 
 
 
330 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  47.45 
 
 
291 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  49.37 
 
 
325 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  47.32 
 
 
336 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  48.09 
 
 
300 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  48.09 
 
 
322 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  48.37 
 
 
351 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  45.43 
 
 
299 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
303 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  47.92 
 
 
294 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  46.37 
 
 
299 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  46.82 
 
 
290 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  46.82 
 
 
290 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  46.82 
 
 
290 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  44.54 
 
 
329 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  42.73 
 
 
312 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  48.89 
 
 
290 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  47.13 
 
 
291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  47.13 
 
 
291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  46.2 
 
 
317 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  42.86 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  46.06 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  47.32 
 
 
306 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 
308 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  42.59 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.17 
 
 
319 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  39.81 
 
 
301 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  40.32 
 
 
303 aa  209  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  39.08 
 
 
361 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.76 
 
 
347 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  38.6 
 
 
349 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  39.14 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.14 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  38.75 
 
 
352 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  39.14 
 
 
349 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  39.14 
 
 
349 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  36.23 
 
 
309 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  39.1 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  36.25 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  41.3 
 
 
259 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 
433 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.82 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.59 
 
 
751 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.46 
 
 
826 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  32.97 
 
 
314 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  33.04 
 
 
316 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26.74 
 
 
586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.83 
 
 
338 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.84 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.81 
 
 
517 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.55 
 
 
348 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.42 
 
 
412 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.23 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  29.55 
 
 
369 aa  109  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
416 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  27.81 
 
 
742 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  31.95 
 
 
416 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  33.48 
 
 
259 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 
356 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  28.85 
 
 
304 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.62 
 
 
481 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  30.88 
 
 
300 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 
319 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>