More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1048 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  69.64 
 
 
310 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  69.64 
 
 
315 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  68.85 
 
 
324 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  67 
 
 
341 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  67 
 
 
334 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  66.01 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  63.7 
 
 
319 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  64.36 
 
 
317 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  66.89 
 
 
325 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  62.17 
 
 
306 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  63.82 
 
 
324 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  61.18 
 
 
327 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  60.07 
 
 
301 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  60.47 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  59.47 
 
 
332 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  58.61 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  55.96 
 
 
308 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  57.1 
 
 
300 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  56.29 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  54.58 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  56.48 
 
 
291 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  51.53 
 
 
329 aa  301  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  51.58 
 
 
384 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  56.95 
 
 
294 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  55.22 
 
 
299 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  51.79 
 
 
287 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  56.15 
 
 
291 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  57.09 
 
 
290 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  56.15 
 
 
291 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  53.67 
 
 
290 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  53.67 
 
 
290 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  49.51 
 
 
330 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  50.63 
 
 
408 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  53.67 
 
 
290 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  49.52 
 
 
409 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 
367 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  54.03 
 
 
299 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  53.64 
 
 
337 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  50.63 
 
 
390 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  48.67 
 
 
358 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  51.5 
 
 
291 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  51.5 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  51.32 
 
 
351 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  56.19 
 
 
306 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  48.17 
 
 
351 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  49.05 
 
 
377 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  48.33 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  49.05 
 
 
421 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  44.76 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.81 
 
 
349 aa  268  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  48.88 
 
 
338 aa  267  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  48.59 
 
 
375 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  47.06 
 
 
312 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  45.72 
 
 
318 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.95 
 
 
303 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  43.97 
 
 
301 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.71 
 
 
308 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  44.55 
 
 
319 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  45.57 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  43.83 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.57 
 
 
319 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  43.18 
 
 
349 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  43.77 
 
 
352 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  42.53 
 
 
349 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  42.86 
 
 
349 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  43.04 
 
 
347 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  41.88 
 
 
349 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  43.14 
 
 
309 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  40.89 
 
 
361 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  41.72 
 
 
351 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  47.56 
 
 
259 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  39.43 
 
 
330 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.86 
 
 
325 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.73 
 
 
433 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.85 
 
 
751 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  30.06 
 
 
369 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  36.69 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  30.56 
 
 
510 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.65 
 
 
742 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.23 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 
517 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  29.66 
 
 
481 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.78 
 
 
348 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.78 
 
 
348 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  31.31 
 
 
316 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 
517 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.65 
 
 
586 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.77 
 
 
614 aa  106  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.05 
 
 
319 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.87 
 
 
829 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.37 
 
 
398 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  29.01 
 
 
356 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.01 
 
 
826 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.31 
 
 
377 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  32.97 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.38 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>