More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04261 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  51.79 
 
 
304 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  50.84 
 
 
311 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  49.16 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  51.79 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  50.49 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  51.79 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  49.68 
 
 
334 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  51.9 
 
 
310 aa  279  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  47.23 
 
 
300 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  51.78 
 
 
341 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  47.9 
 
 
306 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  48.01 
 
 
294 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  50.17 
 
 
315 aa  268  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  46.73 
 
 
330 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  47.73 
 
 
327 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  46.93 
 
 
319 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  47.25 
 
 
325 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  48.41 
 
 
317 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  49.17 
 
 
299 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  49.33 
 
 
291 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  46.43 
 
 
332 aa  261  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  45.6 
 
 
337 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  49.5 
 
 
290 aa  258  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  46.8 
 
 
290 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  46.8 
 
 
290 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  46.8 
 
 
290 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  43.33 
 
 
351 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  47.21 
 
 
331 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  43.54 
 
 
329 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  47.93 
 
 
322 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  42.48 
 
 
358 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  49.33 
 
 
291 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  49.33 
 
 
291 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  44.52 
 
 
299 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  48.56 
 
 
295 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  48.14 
 
 
324 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  43.17 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  45.51 
 
 
337 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  42.24 
 
 
409 aa  234  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  42.86 
 
 
390 aa  234  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  40.95 
 
 
384 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  44.59 
 
 
291 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  43.28 
 
 
336 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  41.93 
 
 
408 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
349 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  44.26 
 
 
341 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
367 aa  228  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  42.41 
 
 
377 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  42.41 
 
 
421 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  42.27 
 
 
338 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  43.43 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  42.67 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.11 
 
 
303 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  45.39 
 
 
306 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  44.24 
 
 
318 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  40.98 
 
 
375 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  43.97 
 
 
303 aa  211  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  41.26 
 
 
319 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.78 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  39.93 
 
 
301 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  44.16 
 
 
309 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  40.13 
 
 
352 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 
319 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  38.93 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  38.93 
 
 
361 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  37.86 
 
 
349 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  38.21 
 
 
349 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  38.21 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  37.86 
 
 
349 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  37.86 
 
 
349 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  39.33 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  36.59 
 
 
351 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.66 
 
 
259 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  32.39 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  30.99 
 
 
510 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.94 
 
 
314 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  29.56 
 
 
316 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  33.2 
 
 
605 aa  92.4  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.2 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 
517 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  33.21 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  33.45 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  26.58 
 
 
356 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  30.36 
 
 
437 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  30.34 
 
 
892 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  26.23 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  31.38 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 
628 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  29.77 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  28.8 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  26.85 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.52 
 
 
433 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 
861 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.13 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  27.87 
 
 
624 aa  82.4  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  25.72 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.52 
 
 
751 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>