More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3544 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  94.84 
 
 
349 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  98.85 
 
 
349 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  94.27 
 
 
349 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  93.7 
 
 
349 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  90.17 
 
 
347 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  80.95 
 
 
361 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  59.31 
 
 
352 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  48.52 
 
 
337 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  45.6 
 
 
341 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  43.17 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  46.36 
 
 
351 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  44.59 
 
 
336 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  45.61 
 
 
291 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  44.55 
 
 
324 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 
367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  41.77 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  41.92 
 
 
331 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  41.94 
 
 
327 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  38.85 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  42.62 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  37.22 
 
 
358 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  42.9 
 
 
337 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  42.53 
 
 
304 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  41.5 
 
 
301 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  40.71 
 
 
319 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  40.43 
 
 
409 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  41.94 
 
 
306 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  39.94 
 
 
310 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  40.34 
 
 
351 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  40.19 
 
 
334 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  40.32 
 
 
307 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  41.7 
 
 
309 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  43.43 
 
 
299 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  40.84 
 
 
315 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  39.63 
 
 
408 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  39.2 
 
 
325 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  39.14 
 
 
390 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  43.55 
 
 
294 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  42.56 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  42.56 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  42.56 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  38.29 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  41.37 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  40.55 
 
 
329 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  40.59 
 
 
300 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 
303 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  39.48 
 
 
341 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  41.34 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  42.23 
 
 
299 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  38.34 
 
 
384 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  39.76 
 
 
375 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  38.69 
 
 
322 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  40.21 
 
 
301 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  37.69 
 
 
384 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  37.58 
 
 
332 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  40 
 
 
295 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.76 
 
 
319 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  38.36 
 
 
421 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  38.36 
 
 
377 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 
308 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  42.81 
 
 
290 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  39.16 
 
 
324 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  40.54 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  37.86 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  41.25 
 
 
306 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  38.81 
 
 
351 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  37.8 
 
 
330 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  40.08 
 
 
259 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.41 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.77 
 
 
338 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  37.96 
 
 
348 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  37.96 
 
 
348 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.97 
 
 
433 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.36 
 
 
751 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  38.21 
 
 
390 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 
517 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  34.08 
 
 
300 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.52 
 
 
586 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  28.62 
 
 
742 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  29.6 
 
 
259 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.43 
 
 
826 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.7 
 
 
554 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.66 
 
 
517 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  28.87 
 
 
600 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  28.87 
 
 
549 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.08 
 
 
510 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.96 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  31.03 
 
 
556 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.95 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  30.12 
 
 
628 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  33.33 
 
 
605 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  33.33 
 
 
481 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  26.88 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>