More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0527 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  72.7 
 
 		 324 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  70.79 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  71.15 
 
 		 307 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  68.75 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  70.2 
 
 		 325 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  65.8 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  66.67 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  65.13 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  62.62 
 
 		 315 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  61.24 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  60.6 
 
 		 301 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  60.6 
 
 		 306 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  60.33 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  61.83 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  61.67 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  60.83 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  55.96 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  53.73 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  55.05 
 
 		 295 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  57.24 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  61.13 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  55.52 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  52.12 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  57.09 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  55.37 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  50.15 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  54.52 
 
 		 290 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  56.9 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  56.9 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  55.18 
 
 		 299 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  54.52 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  54.52 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  53.87 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  47.28 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  50 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  49.38 
 
 		 408 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  49.22 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  48.77 
 
 		 421 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  48.77 
 
 		 377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  50.5 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.73 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  49.04 
 
 		 338 aa  278  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  46.88 
 
 		 409 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  49.51 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  45.75 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  46.62 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  49.34 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  48 
 
 		 291 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  45.02 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  47.25 
 
 		 287 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  46.69 
 
 		 375 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  46.84 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  47.27 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.25 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  43.52 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  42.9 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.04 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  41.58 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  39.74 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  40.26 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  42.14 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  39.94 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  39.2 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  38.89 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.62 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  38.98 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  38.91 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  39.61 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  39.1 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  38.03 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  40.49 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  40.21 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.41 
 
 		 751 aa  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.47 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31.29 
 
 		 510 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  28.49 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  34.69 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 		 517 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  30.7 
 
 		 742 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.32 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.22 
 
 		 614 aa  103  5e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 1818 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.52 
 
 		 586 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 		 517 aa  99.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.07 
 
 		 481 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  34 
 
 		 259 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.2 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.74 
 
 		 348 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.13 
 
 		 416 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.13 
 
 		 416 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.49 
 
 		 826 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.51 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1911 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.82 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>