More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3225 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
377 aa  785    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  72.3 
 
 
356 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  58.81 
 
 
344 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  42.15 
 
 
369 aa  290  3e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  54.09 
 
 
427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  52.56 
 
 
454 aa  242  9e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  52.05 
 
 
458 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  51.8 
 
 
464 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  51.6 
 
 
455 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  43.44 
 
 
491 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  35.01 
 
 
420 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  33.33 
 
 
396 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  31.64 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  30.47 
 
 
395 aa  155  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
510 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  31.12 
 
 
548 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  30.12 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.39 
 
 
351 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 
367 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  29.88 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  27.63 
 
 
327 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  30.07 
 
 
312 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
319 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
303 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  31.13 
 
 
358 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  29.07 
 
 
1911 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  28.88 
 
 
324 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  29.29 
 
 
338 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.33 
 
 
433 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
554 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
308 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  28.02 
 
 
409 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  27.19 
 
 
331 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  28.31 
 
 
304 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.9 
 
 
325 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.49 
 
 
614 aa  100  6e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  28.13 
 
 
306 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  28.74 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  28.53 
 
 
325 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.09 
 
 
349 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  28.97 
 
 
384 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  40.24 
 
 
325 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  37.01 
 
 
566 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.97 
 
 
517 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  28.07 
 
 
421 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  28.07 
 
 
377 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  27.83 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  33 
 
 
563 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  26.92 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  28.4 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 
267 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  27.81 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  34.75 
 
 
532 aa  95.9  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  27.71 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  28.62 
 
 
337 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
1818 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.78 
 
 
291 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 
517 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  35.79 
 
 
259 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  28.75 
 
 
295 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
861 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  29.57 
 
 
390 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  28.16 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  29.72 
 
 
265 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  27.12 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  29.43 
 
 
301 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.18 
 
 
826 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  26.06 
 
 
1201 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  27.42 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  30.07 
 
 
265 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26.54 
 
 
586 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  27.05 
 
 
285 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  30.45 
 
 
286 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  29.62 
 
 
262 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  27.82 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  26.04 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.68 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  36.22 
 
 
1581 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  26.6 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 
751 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  27.72 
 
 
338 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  28.39 
 
 
311 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  27.43 
 
 
426 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  26.91 
 
 
276 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  26.02 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  27.46 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  28.17 
 
 
292 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  25.53 
 
 
1132 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  26.46 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  28.1 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  27.21 
 
 
1492 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 
1053 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>