240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3494 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  100 
 
 		 396 aa  827    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  59.47 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  54.63 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  47.99 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  38.96 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  38.96 
 
 		 548 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  37.47 
 
 		 566 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  37.88 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  34 
 
 		 344 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  34.18 
 
 		 356 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  35.1 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  40.64 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  36.26 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  33.24 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  30.66 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  36.7 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  35.63 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  35.21 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  35.64 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  26.54 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  27.19 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  28.11 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1911 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  26.84 
 
 		 527 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  26.61 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  26 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  25.49 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  26.33 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 		 861 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25.53 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  24.55 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  24.63 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  25.8 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  25.06 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  25.86 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  26.58 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  25.21 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  27.22 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  25.14 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  25.46 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  25.87 
 
 		 1104 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  25.14 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.84 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  28.46 
 
 		 862 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.78 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  25.76 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  26.58 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  26.79 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  25.58 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  24.37 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  26.51 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  24.33 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  33.69 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  23.2 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  25.45 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2099  hypothetical protein  26.12 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0544192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  25.73 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  25.07 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  25.58 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1200 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  28.82 
 
 		 1049 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  27.35 
 
 		 1132 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  25.21 
 
 		 654 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.3 
 
 		 820 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  24.31 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  25.41 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  30.05 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  24.19 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  25.57 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 637 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  25.86 
 
 		 802 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  22.62 
 
 		 826 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  23.44 
 
 		 742 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  26.8 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  26.54 
 
 		 538 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 		 639 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  32.42 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 623 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 		 620 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 		 639 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  25.81 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  32.42 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.42 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  23.44 
 
 		 829 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  25.45 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  24.52 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  23.26 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  25.91 
 
 		 522 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  25.6 
 
 		 664 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  27.7 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  23.62 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>