234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0756 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  64.64 
 
 
566 aa  728    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  100 
 
 
548 aa  1135    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  63.02 
 
 
563 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  39.74 
 
 
510 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  38.65 
 
 
532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  40.46 
 
 
420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  39.21 
 
 
420 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  38.96 
 
 
396 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  39.25 
 
 
395 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 
356 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 
377 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  32.5 
 
 
464 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  29.32 
 
 
369 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  27.22 
 
 
427 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  33.04 
 
 
458 aa  97.1  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  47.41 
 
 
455 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  35.36 
 
 
344 aa  90.9  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  42.74 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  41.27 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  27 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  27.33 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  27.4 
 
 
307 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  25.96 
 
 
331 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  29.52 
 
 
301 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  38 
 
 
334 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  27.83 
 
 
341 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  35.29 
 
 
304 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  38.83 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  40.2 
 
 
324 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  39.22 
 
 
319 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  39.22 
 
 
408 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  38.83 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  38.24 
 
 
300 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 
358 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2099  hypothetical protein  22.31 
 
 
452 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0544192  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  38.46 
 
 
329 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  24.75 
 
 
327 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.06 
 
 
303 aa  57.4  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.34 
 
 
1911 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  33.64 
 
 
312 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  38.61 
 
 
291 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  38.61 
 
 
291 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  38.61 
 
 
291 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  39.22 
 
 
325 aa  57  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
623 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  39.05 
 
 
375 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  26.07 
 
 
351 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  35.71 
 
 
862 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  32.85 
 
 
322 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  35.09 
 
 
538 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  39.22 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  39.6 
 
 
338 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  34.82 
 
 
381 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
861 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.9 
 
 
1104 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  25.24 
 
 
293 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  35.24 
 
 
384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  34.82 
 
 
527 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  35.14 
 
 
409 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  35.24 
 
 
390 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 
349 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
433 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  36.89 
 
 
306 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  36.63 
 
 
338 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 
517 aa  53.9  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  38.83 
 
 
299 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  32.67 
 
 
330 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  36.27 
 
 
570 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 
740 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  33.05 
 
 
453 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
637 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
303 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  29.45 
 
 
356 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  38.1 
 
 
299 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  37.62 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  31.86 
 
 
325 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  36.89 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  34.51 
 
 
1007 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0078  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
872 aa  51.6  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  34 
 
 
310 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  35.92 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.28 
 
 
603 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  35.58 
 
 
446 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  33.9 
 
 
263 aa  51.2  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  34.26 
 
 
551 aa  51.2  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  37.76 
 
 
290 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
554 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  37.76 
 
 
290 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  37.76 
 
 
290 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.11 
 
 
413 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  30.94 
 
 
929 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  34.86 
 
 
584 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.91 
 
 
1041 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 
301 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  31.45 
 
 
426 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  36.27 
 
 
535 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  34.38 
 
 
277 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  35.58 
 
 
960 aa  50.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>