238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05475 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  64.64 
 
 		 548 aa  728    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  100 
 
 		 566 aa  1164    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  66.67 
 
 		 563 aa  761    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  40.04 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  37.94 
 
 		 532 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  40.69 
 
 		 420 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  37.47 
 
 		 396 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  43.41 
 
 		 420 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  39.78 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  27.76 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  29.85 
 
 		 369 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  37.01 
 
 		 377 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  35.06 
 
 		 356 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  45.24 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  40.8 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  46.09 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  46.55 
 
 		 454 aa  87  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  48.15 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  43.59 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.74 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 308 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2099  hypothetical protein  25.15 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0544192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  38.33 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  35.83 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  40.95 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  40.95 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  40.2 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  38.24 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  37.14 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  37 
 
 		 334 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  41.58 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  38.1 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  38.1 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  40.78 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  37.25 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  41.51 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  40.78 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  37.14 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  39.42 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  38.83 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  37.62 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  38.24 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  39 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  38.61 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  39 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  39 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  37 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  39.6 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  35.51 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  36.63 
 
 		 301 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1911 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  33.04 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  34.82 
 
 		 330 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 		 570 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  32.61 
 
 		 233 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  32.8 
 
 		 303 aa  54.7  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  35.65 
 
 		 351 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  36.63 
 
 		 332 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  33.05 
 
 		 263 aa  53.9  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  40 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  29.11 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  33.04 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.96 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 740 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  37.39 
 
 		 1160 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  33.61 
 
 		 288 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  36 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  34.71 
 
 		 291 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  32.5 
 
 		 306 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 289 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  36.89 
 
 		 299 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  38.24 
 
 		 317 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  30.54 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  36 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  37.39 
 
 		 1007 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  34.17 
 
 		 600 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  33.93 
 
 		 862 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  36.27 
 
 		 1492 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.51 
 
 		 348 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0887  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 		 267 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.51 
 
 		 348 aa  51.2  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  37.12 
 
 		 1049 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  35.14 
 
 		 628 aa  51.2  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  34.17 
 
 		 549 aa  50.8  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  38.24 
 
 		 323 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  41.18 
 
 		 338 aa  50.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1196 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  31.09 
 
 		 321 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  50.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 861 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1581 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  30.51 
 
 		 230 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  33.66 
 
 		 325 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.67 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  33 
 
 		 315 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>