More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0887 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0887  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 267 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  30.59 
 
 		 384 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  35.2 
 
 		 408 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  33.92 
 
 		 358 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  31.32 
 
 		 421 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  31.46 
 
 		 377 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  30.18 
 
 		 409 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.28 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  31.61 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2417  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  31.84 
 
 		 390 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  34.03 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  34.36 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  31.18 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  30.95 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  32.2 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  30.99 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.65 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.55 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 861 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  31.06 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  29.65 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  31.25 
 
 		 417 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 		 447 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  32.37 
 
 		 384 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  25.9 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  28.86 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  30.99 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  33.11 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  31.67 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  32.07 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  31.72 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  33.09 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  33.09 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  28.8 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.66 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0704  hypothetical protein  35.58 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1659  hypothetical protein  35.58 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0594  hypothetical protein  35.58 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0754  hypothetical protein  35.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0886738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  27.51 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  32.61 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.03 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2108  hypothetical protein  35.58 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  25.71 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.51 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  29.24 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  34.5 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  30.48 
 
 		 422 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  31.72 
 
 		 487 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  30.6 
 
 		 766 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  29.59 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  24.71 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  29.59 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 621 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  26.7 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  30.68 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  27.57 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  29.69 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  25.82 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2013  hypothetical protein  34.62 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0741124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  31.47 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0521  hypothetical protein  34.62 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  29.59 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  25.91 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.46 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  29.53 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  28.24 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.43 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  28.41 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  27.4 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1520  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  27.93 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.19 
 
 		 506 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  26.13 
 
 		 633 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  26.44 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  31.52 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  26.97 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.5 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  28.41 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.5 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  28.5 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.28 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.5 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03039  signal peptide protein  29.09 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  28.27 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>