242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0918 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  836    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  74.16 
 
 		 418 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  53.35 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  51.96 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  51.5 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  37.38 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  36.34 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  40.28 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  35.55 
 
 		 420 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  35.95 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  33.74 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  34.87 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  33.6 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  28.66 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  32.27 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  30.86 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.02 
 
 		 437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  33.88 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  29.84 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.15 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  29.41 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.02 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  33.72 
 
 		 436 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  33.72 
 
 		 436 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  33.72 
 
 		 436 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  27.33 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  29.95 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  29.64 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.88 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.67 
 
 		 383 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.54 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  26.61 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  29.97 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  31.43 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  29.97 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.48 
 
 		 437 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.55 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  27.83 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  27.83 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  25.85 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  29.46 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  27.37 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  28.67 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  28.43 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  27.8 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  26.76 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  36 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  28.9 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.46 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  27.71 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  38.2 
 
 		 506 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  34.45 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  26.26 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  29.2 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  30.74 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  26.34 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  33.65 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  30.65 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  27.62 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  28.52 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  27.88 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  33.44 
 
 		 448 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  29.02 
 
 		 437 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  25.51 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  31.77 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  33.8 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.74 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  33.64 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  32.04 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  32.99 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  34.11 
 
 		 385 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  30.73 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  26.48 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  30.72 
 
 		 723 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  24.47 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  32.11 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.89 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  32.11 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  31.62 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  29.91 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  31.3 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  31.47 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  28.98 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.98 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  30.12 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  32.87 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  23.88 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  30.79 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  33.8 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  28.15 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>