More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0142 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1266    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  35.18 
 
 		 262 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  33.67 
 
 		 265 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  33.83 
 
 		 270 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  25.88 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 842 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 		 1818 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.58 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  28.77 
 
 		 510 aa  90.5  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 		 554 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.33 
 
 		 398 aa  88.6  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 303 aa  87.8  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 		 319 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  30.58 
 
 		 304 aa  87  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.16 
 
 		 437 aa  86.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  26.44 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  29.96 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  30.8 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  28.96 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 367 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1581 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  25.87 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  31.5 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.38 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  27 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 308 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  31.36 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  27.76 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  26.24 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  27 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  30.85 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  25.62 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  28.7 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  27.61 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.05 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  28.74 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  27.32 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.92 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  26.7 
 
 		 766 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.32 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  27.52 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0142  protein of unknown function DUF323  29.15 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.741056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.48 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  26.95 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  26.64 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.72 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  26.01 
 
 		 1007 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  27.31 
 
 		 664 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  26.15 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.91 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  29.59 
 
 		 433 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  28.74 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  28.51 
 
 		 384 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  26.32 
 
 		 285 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  23.36 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  29.26 
 
 		 325 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  23.92 
 
 		 446 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.13 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.39 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  27.42 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  26.46 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  27.34 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  24.27 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.21 
 
 		 829 aa  70.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1911 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  26.61 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 		 668 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.72 
 
 		 517 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  27.13 
 
 		 263 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  26.07 
 
 		 922 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  27.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  27.87 
 
 		 377 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1492 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  25.7 
 
 		 276 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  27.96 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  29.23 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  29.23 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.67 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  26.17 
 
 		 929 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  23.83 
 
 		 952 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  29.23 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.72 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>