More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1031 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  93.51 
 
 		 262 aa  507  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  90.19 
 
 		 265 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  81.06 
 
 		 270 aa  434  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2231  hypothetical protein  92.66 
 
 		 153 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1045  hypothetical protein  93.52 
 
 		 134 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2245  hypothetical protein  88.07 
 
 		 118 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2255  hypothetical protein  89.16 
 
 		 87 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  37.93 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  35.11 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  33.99 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  36.07 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 		 621 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  40.09 
 
 		 311 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  34.3 
 
 		 312 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  38.04 
 
 		 417 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 861 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.15 
 
 		 766 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  33.2 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  30.68 
 
 		 633 aa  105  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  40.31 
 
 		 444 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.28 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  39.29 
 
 		 442 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.08 
 
 		 614 aa  102  6e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  36.21 
 
 		 437 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.58 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 349 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0142  protein of unknown function DUF323  32.71 
 
 		 456 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.741056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 		 1186 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  40.72 
 
 		 442 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.22 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 1818 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 367 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  28.39 
 
 		 358 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  38.27 
 
 		 444 aa  95.5  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.07 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.06 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  37.06 
 
 		 447 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  38.66 
 
 		 437 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  33.21 
 
 		 487 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1581 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  28.91 
 
 		 409 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  28.42 
 
 		 923 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  30.89 
 
 		 334 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  29.18 
 
 		 416 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  33.12 
 
 		 506 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 		 416 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  29.72 
 
 		 377 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  32.14 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  31.09 
 
 		 384 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  32.77 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  29.03 
 
 		 408 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  31.54 
 
 		 304 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.44 
 
 		 510 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  28.06 
 
 		 330 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  29.33 
 
 		 314 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  33.45 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.84 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  32.31 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  27.69 
 
 		 351 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  38.07 
 
 		 468 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31.25 
 
 		 433 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  29.83 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  31.71 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  32.37 
 
 		 481 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  30.77 
 
 		 377 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  32.26 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.25 
 
 		 517 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  30.77 
 
 		 421 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  32.47 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 		 842 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  32.77 
 
 		 436 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  32.77 
 
 		 436 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  32.77 
 
 		 436 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  27.94 
 
 		 1053 aa  85.1  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  30.07 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  32.76 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  31.18 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.04 
 
 		 751 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.71 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  30.64 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  31.01 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  30.82 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  28.77 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  29.8 
 
 		 781 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  25.87 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>