More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2405 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  97.94 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  80.94 
 
 		 336 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  56.15 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  55.63 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  51.34 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  51.66 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  52.15 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  51.5 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  53.59 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  49.01 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  52.16 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  53.47 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  49.51 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  49.5 
 
 		 311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  50.5 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  49.67 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  48.32 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  50.83 
 
 		 317 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  44.97 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  48.04 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  48.58 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  48.31 
 
 		 308 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  48.59 
 
 		 408 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  51.01 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  48.01 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  48.49 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  47.33 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  46.72 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  48.09 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  45.95 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  50.34 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  50.34 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  50.34 
 
 		 290 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  49.01 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  47 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  44.56 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  46 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  51.01 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  46.6 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  48.85 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  46.56 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  46.56 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  48.81 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  46.64 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  48.43 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  47.12 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  45.45 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  51.34 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  46.67 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  45.6 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  46.67 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  45.45 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  44.97 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  45.6 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  44.97 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  45.28 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  44.26 
 
 		 287 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  38.73 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  43.44 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  42.31 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  41.31 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  47.83 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 303 aa  202  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  43.24 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.16 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  40.5 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  38.93 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  42.21 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  38.27 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  41.76 
 
 		 259 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  33.87 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.16 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  35.35 
 
 		 259 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.7 
 
 		 517 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  30.51 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.62 
 
 		 751 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.17 
 
 		 614 aa  92  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.42 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.82 
 
 		 510 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 826 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  28.67 
 
 		 742 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  28.75 
 
 		 600 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  28.75 
 
 		 549 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  30.03 
 
 		 556 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  28.02 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  31.94 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.69 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.57 
 
 		 829 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.89 
 
 		 586 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 481 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 621 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  31.53 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>