More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2895 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  79.51 
 
 
390 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  78.63 
 
 
408 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  76.25 
 
 
384 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  67.93 
 
 
377 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  67.93 
 
 
421 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  64.18 
 
 
375 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.7 
 
 
349 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 
367 aa  329  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  50.47 
 
 
338 aa  325  6e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  49.08 
 
 
351 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  46.81 
 
 
384 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  49.52 
 
 
304 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  47.37 
 
 
301 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  47.8 
 
 
358 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  50.16 
 
 
337 aa  285  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  48.59 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  46.75 
 
 
334 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  47.11 
 
 
341 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  47.81 
 
 
315 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  46.88 
 
 
325 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  46.52 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  47.8 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  46.71 
 
 
310 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  45.57 
 
 
319 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  46.56 
 
 
327 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  46.86 
 
 
337 aa  270  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  48.58 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  46.39 
 
 
306 aa  269  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  45.07 
 
 
311 aa  269  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  47.78 
 
 
291 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  49.04 
 
 
300 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  46.82 
 
 
291 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  49.37 
 
 
325 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  47.96 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  45.57 
 
 
308 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  46.84 
 
 
295 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  43.33 
 
 
330 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  42.95 
 
 
331 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  47.02 
 
 
351 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  44.97 
 
 
322 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  44.79 
 
 
299 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
303 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  46.5 
 
 
291 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  46.5 
 
 
291 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  44.67 
 
 
329 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  46.32 
 
 
317 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  45.48 
 
 
299 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  45.37 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  46.82 
 
 
290 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  46.82 
 
 
290 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  46.82 
 
 
290 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  45.69 
 
 
294 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  42.24 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  41.69 
 
 
312 aa  233  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  45.4 
 
 
290 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  46.37 
 
 
306 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
308 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  42.41 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.22 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  40.67 
 
 
347 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  40.38 
 
 
303 aa  212  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  39.87 
 
 
301 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  39.44 
 
 
361 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  39.94 
 
 
349 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.43 
 
 
349 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.82 
 
 
349 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  39.82 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  39.82 
 
 
349 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
319 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  36.01 
 
 
309 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  38.35 
 
 
352 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  38.39 
 
 
351 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  35 
 
 
330 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  39.59 
 
 
259 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.44 
 
 
433 aa  143  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.1 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.74 
 
 
751 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.38 
 
 
826 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  32.46 
 
 
316 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  34.62 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.56 
 
 
586 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.45 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 
517 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  30.03 
 
 
742 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.48 
 
 
510 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  30.38 
 
 
259 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.25 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.61 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  28.53 
 
 
369 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.9 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.2 
 
 
348 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 
356 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31.65 
 
 
614 aa  108  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  32.27 
 
 
549 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  32.27 
 
 
600 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.71 
 
 
829 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>