More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2681 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  58.12 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  56.15 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  58.08 
 
 		 291 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  54.43 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  54.46 
 
 		 324 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  52 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  50.17 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  54.46 
 
 		 307 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  53.64 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  51.14 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  52.72 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  50.62 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  51.66 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  50.48 
 
 		 409 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  51.84 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50.17 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  51 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  51.31 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  50.79 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  53.4 
 
 		 299 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  52.2 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  50.5 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  47.25 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  48.17 
 
 		 408 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  52.51 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  49.68 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  49.34 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  48.76 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  51.69 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  46.86 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  50 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  50 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 		 367 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  50.32 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  47.35 
 
 		 351 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  49 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  52.41 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  51.85 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  48.7 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  50.49 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  50.65 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  48.99 
 
 		 290 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  49.32 
 
 		 290 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  50.51 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  49.32 
 
 		 290 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  45.7 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  48.04 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  48.37 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  48.84 
 
 		 295 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  41.38 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  48.99 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  48.85 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  47.5 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  49.2 
 
 		 352 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.32 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  48.52 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  48.53 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  52.07 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  47.96 
 
 		 319 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  51.85 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  51.85 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  45.51 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  45.39 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  46.9 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  45.48 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  50.49 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  45.32 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  41.18 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  48.66 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  36.71 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 621 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  39.45 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  33.1 
 
 		 259 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.76 
 
 		 751 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.1 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.92 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.42 
 
 		 742 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  36.68 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  34.08 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.29 
 
 		 390 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  34.92 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  34.09 
 
 		 605 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.95 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.29 
 
 		 829 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.06 
 
 		 628 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  40.11 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  31.23 
 
 		 624 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.88 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.76 
 
 		 586 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 861 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  32.99 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  34.27 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>