More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8069 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 324 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  84.83 
 
 		 325 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  76.16 
 
 		 334 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  74.38 
 
 		 341 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  75.17 
 
 		 307 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  70.19 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  72.7 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  68.42 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  69.41 
 
 		 310 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  68.85 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  66.23 
 
 		 315 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  66.67 
 
 		 306 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  68.32 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  65.23 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  64.57 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  66.01 
 
 		 317 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  60.33 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  61.72 
 
 		 311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  57.37 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  57.33 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  59.93 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  57.89 
 
 		 291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  57.24 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  53.92 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  56.72 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  55.74 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  55.74 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  55.74 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  56.11 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  55.92 
 
 		 299 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  57.7 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  57.57 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  57.57 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.88 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  61.33 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  50.65 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  55.63 
 
 		 341 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  55.15 
 
 		 291 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  54.46 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  53.31 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  49.1 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  50.63 
 
 		 384 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50.5 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  46.01 
 
 		 384 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  50.8 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  49.1 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  48.59 
 
 		 409 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  51.79 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  49.06 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  49.06 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  46.86 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  47.76 
 
 		 358 aa  281  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  50 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  49.84 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.98 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  46.93 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  47.85 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  45.21 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  43.65 
 
 		 301 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  44.87 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  44.55 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  44.55 
 
 		 349 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  44.55 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  44.55 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  42.95 
 
 		 361 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  43.59 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.31 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 		 319 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  42.63 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  41.03 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  38.97 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  44.25 
 
 		 259 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  39.43 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  35.01 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31.01 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.09 
 
 		 751 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.23 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.55 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.23 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  30.72 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.83 
 
 		 742 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.33 
 
 		 586 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.03 
 
 		 826 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.81 
 
 		 517 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 		 554 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.73 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 621 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.36 
 
 		 614 aa  106  7e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.88 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.73 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.56 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  31.63 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  36.53 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 		 1104 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.78 
 
 		 439 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>