More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0687 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  889    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  54.78 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  54.67 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  51.75 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  55.2 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  51.51 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  51.86 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  51.83 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  50.35 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  51.75 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  50.78 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  51.03 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  50.58 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  49.13 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  47.88 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  45.62 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  45.62 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  45.62 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  46.45 
 
 		 429 aa  325  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  46.7 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  46.17 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  45.64 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  40.41 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  38.27 
 
 		 416 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  39.37 
 
 		 766 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  41.74 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  35.41 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  37.66 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  34.26 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  35.99 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.26 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  33.86 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  36.07 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  35.25 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  33.86 
 
 		 432 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  32.68 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  34.37 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  33.18 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  35.57 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  35.43 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  32.44 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  35.02 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  31.44 
 
 		 420 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  35.28 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  35.19 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  34.52 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  34.68 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  35.12 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  32.59 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  33.04 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  32.46 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  35.42 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  36.13 
 
 		 433 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  33.03 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  32.31 
 
 		 423 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  32.59 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  32.66 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  33.71 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  31.13 
 
 		 819 aa  173  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  31.97 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  32.6 
 
 		 433 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  34.57 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  34.63 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  31.8 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  34.37 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  32.74 
 
 		 441 aa  170  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  31.63 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  35.02 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  32.82 
 
 		 417 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  35.02 
 
 		 451 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  31.28 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  34.98 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  33.49 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  35.07 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  35.41 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  34.11 
 
 		 723 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  33.41 
 
 		 385 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.15 
 
 		 384 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  32.81 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  33.99 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  31.6 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  33.84 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  32.08 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  33.02 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  30.8 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  32.33 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  31.29 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  29.52 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  32.59 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  29.66 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  32.51 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  31.71 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  29.29 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  32.32 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  32.26 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>