More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1081 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
447 aa  899    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  68.82 
 
 
468 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  67.75 
 
 
442 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  67.29 
 
 
444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  67.29 
 
 
444 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  65.83 
 
 
437 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  67.14 
 
 
446 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  62.76 
 
 
442 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  59.33 
 
 
487 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  60.05 
 
 
446 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  60.51 
 
 
433 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  61.71 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  55.56 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  52.55 
 
 
437 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  52.44 
 
 
436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  52.44 
 
 
436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  52.44 
 
 
436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  53.42 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  54.19 
 
 
425 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  52.51 
 
 
429 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  53.9 
 
 
448 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  45.27 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  39.64 
 
 
766 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  37.79 
 
 
412 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.89 
 
 
417 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  34.24 
 
 
436 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  34.73 
 
 
416 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 
416 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  42.52 
 
 
424 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 
414 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  31.92 
 
 
444 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  36.81 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  34.07 
 
 
427 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  33.71 
 
 
425 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  34.36 
 
 
428 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  33.94 
 
 
428 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  32.04 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  35.98 
 
 
374 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  33.78 
 
 
430 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  34.02 
 
 
432 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  33.71 
 
 
441 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  35.99 
 
 
434 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 
429 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  32.43 
 
 
429 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  33.79 
 
 
423 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  39.62 
 
 
819 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  30.51 
 
 
420 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  32.41 
 
 
425 aa  167  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  34.08 
 
 
434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  32.97 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  32.39 
 
 
437 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  32.21 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  35.19 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  30.84 
 
 
438 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  32.66 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  31.82 
 
 
437 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  33.51 
 
 
447 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  33.48 
 
 
437 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 
434 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  33.56 
 
 
433 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  36.3 
 
 
430 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  33.56 
 
 
415 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  34.31 
 
 
412 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  34.36 
 
 
433 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  35.38 
 
 
423 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  30.24 
 
 
432 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  34.29 
 
 
439 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  33.11 
 
 
415 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  32.72 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  32.92 
 
 
420 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  32.71 
 
 
374 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  31.44 
 
 
416 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  32.14 
 
 
470 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  40.62 
 
 
433 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  40.62 
 
 
433 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  33.11 
 
 
408 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  30.31 
 
 
433 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  32.65 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  30.84 
 
 
425 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  32.3 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  33.63 
 
 
453 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
455 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  30.16 
 
 
384 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  33.64 
 
 
453 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  32.92 
 
 
420 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  31.92 
 
 
386 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  31.81 
 
 
383 aa  143  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  32.67 
 
 
420 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  29.58 
 
 
419 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  31.05 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  27.31 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  33.87 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  30.46 
 
 
723 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  27.07 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  30.47 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28.21 
 
 
398 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  31.28 
 
 
422 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  28.8 
 
 
417 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  34.19 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>