More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1006    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  68.26 
 
 		 487 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  60.29 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  59.48 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  56.69 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  56 
 
 		 442 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  56.12 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  54.97 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  56.18 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  54.91 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  55.35 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  53.99 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  52.32 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  50.73 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  50.73 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  50.73 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  51.55 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  51.45 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  49.49 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  47.74 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  50.83 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  42.94 
 
 		 446 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 416 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.85 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  35.66 
 
 		 766 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  33.06 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  37.37 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  28.8 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.12 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  35.06 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  32.29 
 
 		 429 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  33.75 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  33.19 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  37.2 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  31 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  32.7 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  40.58 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  32.24 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  31.26 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  37.76 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  37.46 
 
 		 819 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  35.74 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  31.39 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  38.05 
 
 		 434 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  32.68 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  38.51 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  38.19 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  38.26 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 		 374 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  27.88 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  36.22 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  31.02 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  36.45 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  32.43 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  39.35 
 
 		 425 aa  157  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  31.23 
 
 		 470 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  35.78 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  32.01 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  36.83 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  31.85 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  34.98 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  38.1 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  34.11 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  29.53 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  30.64 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  29.84 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  37.98 
 
 		 425 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  39.05 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  39.05 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  37.7 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 		 385 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  30.9 
 
 		 455 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  36.36 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  27.86 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  35.71 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  28.66 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  29.42 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  28.11 
 
 		 418 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  35.09 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  28.21 
 
 		 427 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  27.4 
 
 		 433 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  28.78 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  28.26 
 
 		 437 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  33.77 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  27.96 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  30.1 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  28.31 
 
 		 418 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  32.81 
 
 		 393 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  30.3 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  30.3 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  34.63 
 
 		 723 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  33.44 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  31.85 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  28.66 
 
 		 386 aa  131  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  29.48 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>