254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1756 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  866    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  77.11 
 
 		 433 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  57.88 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  48.31 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  47.31 
 
 		 416 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  43.64 
 
 		 374 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  43.64 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  43.14 
 
 		 374 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  39.31 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  37.62 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  38.19 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  36.67 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  36.28 
 
 		 432 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  35.65 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  40.21 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  35.34 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  34.13 
 
 		 414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  31.37 
 
 		 444 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.17 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  31.44 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31.57 
 
 		 433 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  32.18 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.53 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.53 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.53 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.04 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  30.62 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.58 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  29.25 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  30.6 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  30.75 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.89 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25.73 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  30.82 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  30.19 
 
 		 429 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  30.04 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.48 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.74 
 
 		 766 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  28.96 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  30.61 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  32.13 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.06 
 
 		 442 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  29.83 
 
 		 427 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  30.47 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.35 
 
 		 506 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  29.88 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  27.43 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  28.22 
 
 		 437 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  31.48 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  28.1 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  31.39 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  33.03 
 
 		 430 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  28.5 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  28.92 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  28.61 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  29.93 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  25.28 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  30.17 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  30.39 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  27.31 
 
 		 819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  29.43 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  29.41 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  28.6 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  29.43 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  30.89 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  28.86 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  26.03 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  25.17 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  30.63 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  29.04 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  29.66 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  29.41 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  28.27 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  29.87 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  34.42 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  40.57 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  28.51 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  29.98 
 
 		 470 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  27.45 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  29.44 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 		 417 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25.33 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  28.4 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  28.67 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  28.86 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  27.29 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  30.92 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  40.09 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  40.09 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  40.09 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  28.54 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  28.92 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  31.11 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>