279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4834 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  875    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  60.5 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  60.46 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  60.66 
 
 
453 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  52.96 
 
 
408 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  51.06 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  53.85 
 
 
437 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  52.15 
 
 
430 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  50.58 
 
 
437 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  51.78 
 
 
429 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  50.82 
 
 
433 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  49.65 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  52.37 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  52.38 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  51.06 
 
 
423 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  54.87 
 
 
428 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  47.66 
 
 
441 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  50.84 
 
 
418 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  52.14 
 
 
423 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  50.36 
 
 
425 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  52.13 
 
 
434 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  50.69 
 
 
428 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  47.25 
 
 
432 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  50.36 
 
 
438 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  52.39 
 
 
404 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  50.48 
 
 
459 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  50.6 
 
 
425 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  50.72 
 
 
415 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  52.07 
 
 
423 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  50.12 
 
 
427 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  50.12 
 
 
417 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  54.15 
 
 
426 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  51.55 
 
 
407 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  48.58 
 
 
426 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  49.19 
 
 
432 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  50.96 
 
 
415 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  51.08 
 
 
411 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  49.64 
 
 
419 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  51.07 
 
 
408 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  51.08 
 
 
408 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  47.97 
 
 
418 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  50.84 
 
 
408 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  52.94 
 
 
434 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  47.83 
 
 
385 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  51.05 
 
 
412 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  49.53 
 
 
419 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  50.96 
 
 
451 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  51.21 
 
 
425 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  50.96 
 
 
411 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  47 
 
 
383 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  46.01 
 
 
412 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  53.63 
 
 
418 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  49.76 
 
 
415 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  45.08 
 
 
395 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  52.45 
 
 
434 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  48.44 
 
 
420 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  47.69 
 
 
425 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  51.67 
 
 
418 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  50.84 
 
 
451 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  50 
 
 
723 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  43.53 
 
 
427 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  52.31 
 
 
448 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  48.68 
 
 
422 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  46.63 
 
 
415 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  46.88 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  49.51 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  52.57 
 
 
433 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  46.9 
 
 
420 aa  352  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  46.54 
 
 
429 aa  352  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  46.67 
 
 
420 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  48.08 
 
 
393 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  46.14 
 
 
388 aa  342  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  51.34 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  44.98 
 
 
398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  51.24 
 
 
433 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  46.68 
 
 
455 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  46.23 
 
 
383 aa  333  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  38.92 
 
 
386 aa  325  7e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  32.43 
 
 
436 aa  270  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  34.24 
 
 
446 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  32.96 
 
 
437 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.93 
 
 
412 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  32.07 
 
 
468 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  32.05 
 
 
446 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.78 
 
 
442 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  32.87 
 
 
439 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  32.27 
 
 
433 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  32.57 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  29.68 
 
 
417 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  36.96 
 
 
506 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
442 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  32.72 
 
 
437 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  30.98 
 
 
444 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.64 
 
 
447 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.98 
 
 
374 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  34.18 
 
 
409 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  33.82 
 
 
374 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 
446 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  30.91 
 
 
444 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  30.54 
 
 
766 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>