248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6100 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 398 aa  828    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  60.76 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  57.54 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  59.85 
 
 		 383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  54.29 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  58.23 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  50.36 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  49.05 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  49.75 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  49.39 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  47.96 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  49.11 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  48.85 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  46.8 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  46.92 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  49.11 
 
 		 459 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  46 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  48.72 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  47.17 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  47.71 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  46.56 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  48.33 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  46.92 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  48.57 
 
 		 408 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  49.53 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  46.27 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  47.97 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  46.54 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  46.25 
 
 		 415 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  47.47 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  46.65 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  47 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  46.62 
 
 		 423 aa  344  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  48.58 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  45.75 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  46.43 
 
 		 423 aa  342  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  46.75 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  45.7 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  44.47 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  47.23 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  45.66 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  46.35 
 
 		 723 aa  339  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  48.83 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  48.79 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  45.52 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  43.81 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  48.99 
 
 		 451 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  48.99 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  43.65 
 
 		 470 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  46.95 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  46.55 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  48.48 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  48.24 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  46.15 
 
 		 422 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  44.02 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  47.67 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  46.77 
 
 		 420 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  44.5 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  45.82 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  48.71 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  47.37 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  46.11 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  46.25 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  46.96 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  42.3 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  44.64 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  42.52 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  45.37 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  46.96 
 
 		 408 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  46.93 
 
 		 408 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  46.93 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  40.15 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  42.51 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  44.76 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  44.81 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  44.36 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  45.04 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  35.99 
 
 		 436 aa  279  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  39.06 
 
 		 432 aa  278  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  31.57 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  30.37 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  32.51 
 
 		 439 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  31.17 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  30.61 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  30.91 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  29.48 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  30.27 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  29.66 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  28.89 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  27.83 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  29.12 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  32.75 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  31.62 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31.26 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  27.76 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  30.11 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  29.97 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  35.68 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>