254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3413 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  88.04 
 
 		 420 aa  746    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  87.32 
 
 		 420 aa  743    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 420 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  76.83 
 
 		 422 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  71.67 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  72.41 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  65.19 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  64.06 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  60.92 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  62.86 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  59.86 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  59.57 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  62.53 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  54.2 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  52.57 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  56.08 
 
 		 723 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  54.33 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  50.23 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  52.02 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  50.93 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  51.2 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  50.96 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  51.37 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  51.52 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  50.58 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  51.86 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  48.8 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  48.9 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  48.03 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  49.41 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  50 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  53.71 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  49.88 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  53.37 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  52.62 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  53.45 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  53.45 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  49.27 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  51.82 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  51.98 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  53.59 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  49.63 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  52.56 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  53.45 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  49.61 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  53.27 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  52.16 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  52 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  51.65 
 
 		 414 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  52.13 
 
 		 408 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  51.88 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  48.29 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  50 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  45.72 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  51.15 
 
 		 448 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  46.46 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  47.57 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  48.44 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  46.39 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  50.5 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  47.41 
 
 		 383 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  48.54 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  42.75 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  46.32 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  46.64 
 
 		 453 aa  332  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  49.75 
 
 		 433 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  50.39 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  46.93 
 
 		 453 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  43.11 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  43.41 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  42.93 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  44.91 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  46.27 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  46.11 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  43.67 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  43.38 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  38.03 
 
 		 432 aa  289  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  31.26 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  31.71 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  32.25 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.51 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  29.8 
 
 		 439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  30.53 
 
 		 409 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  33.25 
 
 		 374 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.54 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30.25 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  32.75 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.82 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  29.75 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  30.62 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  29.01 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.93 
 
 		 384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  27.06 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  33.01 
 
 		 506 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  29.24 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.61 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  29.78 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  32.78 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>