291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0893 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  90.05 
 
 		 432 aa  801    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  97.69 
 
 		 432 aa  838    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 432 aa  876    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  52.19 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  51.73 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  38.32 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  38.9 
 
 		 409 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  35.65 
 
 		 420 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  37.47 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  33.89 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  36 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  34.8 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  35.75 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  31.91 
 
 		 386 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  31.78 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25.88 
 
 		 436 aa  152  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.06 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  26.62 
 
 		 444 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  30.19 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.23 
 
 		 439 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.75 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.85 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  35.19 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  34.88 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  29.95 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.64 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.03 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  31.53 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  26.06 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  29.94 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  37.31 
 
 		 437 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  29.98 
 
 		 437 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  31.93 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.43 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  29.34 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  27.29 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  30.17 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  29.85 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  28.61 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  31.67 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  34.94 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  28.9 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  28 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  31.23 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  32.26 
 
 		 506 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  29.47 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  35.25 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  34.89 
 
 		 423 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  28.88 
 
 		 425 aa  126  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 434 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  31.92 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.49 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  29.85 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  31.19 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  29.85 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  38.5 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  30.07 
 
 		 723 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  28.34 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  33.6 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.94 
 
 		 427 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  28.4 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  36.11 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  31.91 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  31.49 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  31.7 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  32.09 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  29.82 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  25.85 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  30.6 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  31.66 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  34.17 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  34.17 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  30.51 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  35.65 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  34.8 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  25.81 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  26.4 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  31.46 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  28.36 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  27.65 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  35.14 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  29.65 
 
 		 429 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  33.87 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  34.65 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  36.19 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  33.87 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  34.52 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>