251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1619 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  46.19 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  37.62 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  42.71 
 
 		 374 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  43.12 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  38.46 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  42.46 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  35.77 
 
 		 433 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  36.55 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  41.43 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  36.19 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  34.57 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  33.89 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  33.65 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.09 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  32.83 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  32.6 
 
 		 418 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  35.11 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  29.52 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.68 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.68 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.68 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.07 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  30.24 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25.28 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.57 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 		 442 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  26.62 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  28.95 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  27.91 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  30.84 
 
 		 428 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  27.83 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  30.19 
 
 		 429 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 		 442 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  25.88 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.53 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.75 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.37 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  27.68 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  30.18 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  30.54 
 
 		 429 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  30.12 
 
 		 429 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 416 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25.46 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  28.21 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  29.34 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  30 
 
 		 437 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  27.76 
 
 		 819 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  29.95 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  30.5 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  29.93 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  31 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  28.95 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  29.88 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  30.02 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  27.32 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  38 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  29.34 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  29.1 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  28.64 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  30.81 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  30.81 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.6 
 
 		 506 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  30.56 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  30.51 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  26 
 
 		 766 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  29.17 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  28.4 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  31.06 
 
 		 723 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  29.61 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  30.89 
 
 		 439 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  28.54 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  27.41 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  29.27 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  30.34 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  25.76 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  28.71 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  28.15 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  27.92 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  29.62 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  29.41 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  27.49 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  27.59 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  33.24 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  30.33 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.79 
 
 		 427 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  28.35 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  29.31 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  29.65 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  28.64 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  26.6 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  28.33 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  29.9 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>