283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3926 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  91.81 
 
 
415 aa  792    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  91.33 
 
 
415 aa  790    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  850    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  56.48 
 
 
434 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  53.77 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  57.14 
 
 
434 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  53.76 
 
 
429 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  56.66 
 
 
434 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  55.61 
 
 
432 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  53.45 
 
 
425 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  52.09 
 
 
438 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  52.48 
 
 
425 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  53.69 
 
 
427 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  55.02 
 
 
429 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  53.61 
 
 
417 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  52.91 
 
 
437 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  52.06 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  51.23 
 
 
430 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  51.16 
 
 
437 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  54.06 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  53.55 
 
 
417 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  53.18 
 
 
419 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  52.76 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  53.16 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  53.35 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  53.77 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  50.48 
 
 
415 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  54.22 
 
 
411 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  48.96 
 
 
426 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  53.16 
 
 
418 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  52.32 
 
 
420 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  54.41 
 
 
411 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  50 
 
 
441 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  54.41 
 
 
451 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  51.34 
 
 
420 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  50.49 
 
 
430 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  50.61 
 
 
428 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  51.73 
 
 
418 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  50.49 
 
 
422 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  48.59 
 
 
437 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  52.66 
 
 
423 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  51.47 
 
 
423 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  54.17 
 
 
451 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  49.76 
 
 
433 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  50.96 
 
 
408 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  49.88 
 
 
420 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  51.25 
 
 
723 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  48.81 
 
 
470 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  51.21 
 
 
426 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  48.49 
 
 
385 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  50.93 
 
 
453 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  49.39 
 
 
412 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  51.31 
 
 
453 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  47.38 
 
 
383 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  50.72 
 
 
404 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  49.3 
 
 
428 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  52.66 
 
 
433 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  51.07 
 
 
414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  47.43 
 
 
393 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  48.15 
 
 
455 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  43.84 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  49.5 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  44.08 
 
 
386 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  50 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  50.6 
 
 
407 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  50.48 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  51.13 
 
 
418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  46.02 
 
 
395 aa  352  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  50.48 
 
 
408 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  44.69 
 
 
412 aa  349  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  52.15 
 
 
433 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  42.79 
 
 
427 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  50.24 
 
 
408 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  47 
 
 
398 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  52.19 
 
 
433 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  45.84 
 
 
383 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  45.98 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  48.85 
 
 
448 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  36.13 
 
 
436 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  35.43 
 
 
437 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  35.84 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.33 
 
 
468 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  32.84 
 
 
487 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.78 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  38.26 
 
 
506 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  34.42 
 
 
433 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.63 
 
 
444 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.85 
 
 
374 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  33.11 
 
 
444 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  32.65 
 
 
447 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.96 
 
 
437 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.51 
 
 
442 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.1 
 
 
446 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.8 
 
 
446 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  32.36 
 
 
384 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 
374 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 
416 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  32.1 
 
 
446 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  32.43 
 
 
386 aa  136  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>