More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1461 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  86.01 
 
 		 434 aa  741    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 434 aa  887    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  95.85 
 
 		 434 aa  836    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  67.06 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  65.64 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  57.21 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  57.14 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  56.21 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  55.97 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  56.53 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  54.27 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  59.85 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  55.74 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  59.67 
 
 		 423 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  56.26 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  56.71 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  52.44 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  54.95 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  60.24 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  51.72 
 
 		 425 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  54.02 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  51.72 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  55.29 
 
 		 723 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  50.69 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  53.7 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  53.64 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  53.3 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  54.23 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  53.11 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  55.11 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  54.42 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  56.08 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  55.13 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  53.02 
 
 		 420 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  53.1 
 
 		 419 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  54.74 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  51.86 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  53.96 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  53.04 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  52.56 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  52.06 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  52.43 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  52.51 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  52.36 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  53.11 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  54.61 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  52.22 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  54.61 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  54.37 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  54.26 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  48.68 
 
 		 383 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  55.83 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  46.67 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  53.99 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  54.37 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  50.83 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  51.68 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  54.23 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  49.88 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  52.46 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  55.95 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  54.02 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  51.07 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  49.63 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  52.94 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  53.04 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  53.97 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  54.1 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  53.74 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  53.74 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  49.64 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  49.53 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  47.32 
 
 		 385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  45.45 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  44.47 
 
 		 412 aa  356  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  45.97 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  42.82 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  40.76 
 
 		 386 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  34.87 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  35.99 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.93 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  35.76 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  38.05 
 
 		 506 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  35.99 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  35.73 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  35.62 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  34.79 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  34.44 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  34.44 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  34.44 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  37.8 
 
 		 487 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  34.68 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.11 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  35.39 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.64 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  29.01 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.14 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  33.26 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.91 
 
 		 374 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  35.31 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>