More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1581 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  100 
 
 
723 aa  1459    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  56.46 
 
 
432 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  55.58 
 
 
437 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  58.44 
 
 
419 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  57.61 
 
 
425 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  56.8 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  54.61 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  57.39 
 
 
415 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  53.33 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  54.13 
 
 
429 aa  439  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  53.58 
 
 
423 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  52.57 
 
 
430 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  55.04 
 
 
408 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  56.09 
 
 
417 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  57.4 
 
 
420 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  56.82 
 
 
420 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  55.98 
 
 
418 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  56.09 
 
 
418 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  57.87 
 
 
422 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  56.78 
 
 
418 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  55.93 
 
 
451 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  51.05 
 
 
427 aa  425  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  54.43 
 
 
419 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  54.48 
 
 
459 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  54.24 
 
 
429 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  55.77 
 
 
434 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  52.91 
 
 
425 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  54.34 
 
 
425 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  55.93 
 
 
411 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  49.77 
 
 
437 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  56.89 
 
 
420 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  51.18 
 
 
430 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  55.45 
 
 
411 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  49.88 
 
 
438 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  54.96 
 
 
451 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  54.06 
 
 
417 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  52.57 
 
 
428 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  55.09 
 
 
404 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  55.42 
 
 
407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  53.21 
 
 
383 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  53.85 
 
 
386 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  54.48 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  54.09 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  54.41 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  49.88 
 
 
426 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  56.02 
 
 
408 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  52.25 
 
 
415 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  48.93 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  55.77 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  56.25 
 
 
408 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  55.47 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  52 
 
 
415 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  52.53 
 
 
423 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  51.13 
 
 
393 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  49.46 
 
 
470 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  51.25 
 
 
415 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  52.78 
 
 
426 aa  392  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  50.39 
 
 
385 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  48.68 
 
 
425 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  51.17 
 
 
453 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  52.39 
 
 
433 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  51.19 
 
 
453 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  47.95 
 
 
383 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  48 
 
 
437 aa  376  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  52.64 
 
 
433 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  52.82 
 
 
433 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  47.69 
 
 
395 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  47.84 
 
 
412 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  43.41 
 
 
427 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  48.45 
 
 
388 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  48.33 
 
 
430 aa  361  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  42.53 
 
 
386 aa  360  7e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  47.7 
 
 
423 aa  357  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  47.78 
 
 
455 aa  356  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  46.35 
 
 
398 aa  353  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  43.39 
 
 
412 aa  345  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  47.5 
 
 
448 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  43.33 
 
 
432 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  56.72 
 
 
323 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  55.45 
 
 
323 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  55.63 
 
 
326 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  32.59 
 
 
766 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  53.82 
 
 
327 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  53.33 
 
 
321 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  52.48 
 
 
323 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  54.81 
 
 
324 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  54.28 
 
 
323 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  56.48 
 
 
330 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  53.14 
 
 
342 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  53.04 
 
 
325 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  56.07 
 
 
323 aa  297  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  53.04 
 
 
325 aa  297  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  56.15 
 
 
327 aa  296  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  49.51 
 
 
329 aa  294  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  53.33 
 
 
310 aa  294  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  53 
 
 
310 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  52.72 
 
 
325 aa  293  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  48.17 
 
 
325 aa  293  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  44.88 
 
 
318 aa  290  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  52.49 
 
 
310 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>