131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1758 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  86.96 
 
 		 323 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  77.33 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  68.63 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  67.49 
 
 		 323 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  66.36 
 
 		 321 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  65.68 
 
 		 327 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  59.62 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  61.51 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  59.29 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  58.75 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  60.26 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  56.68 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  58.42 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  50.32 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  53.63 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  48.84 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  54.72 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  51.88 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  52.48 
 
 		 723 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  52.9 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  51.49 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  53.02 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  53.02 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  51.82 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  53.33 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  53.33 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  53.33 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  53.31 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  55.12 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  53.4 
 
 		 337 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  52.65 
 
 		 310 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  52.38 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  51.23 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  50.68 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  49.83 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  47.48 
 
 		 320 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  47.84 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  51.95 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  51.16 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  51.47 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  51.47 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  47.3 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  51.47 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  48.05 
 
 		 334 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  45.43 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  46.44 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  44.3 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  48.17 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  44.31 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  43.69 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  46.96 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  46.96 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  45.67 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  46.6 
 
 		 366 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  48.5 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  48.5 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  42.86 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  44.29 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  42.66 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  42.24 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  43.85 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  39.38 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  41.48 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  41.81 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  41.81 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  40.92 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  45.64 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  41.45 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  46.91 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  42.18 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  43.37 
 
 		 766 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  42.76 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  43.67 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  40.98 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  42.43 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  41.72 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  42.81 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  43.35 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  39.13 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  36.82 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  45.33 
 
 		 332 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  40.68 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  44.26 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  42 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  44.33 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  42.76 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  41.58 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  38.21 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  40.66 
 
 		 417 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  43.92 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  41 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  41 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  41 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  42.63 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4965  hypothetical protein  38.56 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270287  normal  0.308353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  41.94 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>