128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2462 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  94.92 
 
 		 315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  88.96 
 
 		 314 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  71.43 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  64.35 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  49.18 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  47.51 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  46.13 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  45.33 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  42.95 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  43.05 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  45.45 
 
 		 723 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  44.74 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  41.27 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  42.24 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  41.83 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  43.14 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  43.79 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.57 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  42.9 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  42.3 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  43.62 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  41.64 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  43.71 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  42.62 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  41.72 
 
 		 323 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  44.04 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  36.04 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  41.12 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  44.04 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  40.79 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  40.79 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  42.38 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  43.32 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  43.32 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  41.1 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  43 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  40.78 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  42.67 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  42.67 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.53 
 
 		 325 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  42.53 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  42.53 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  41.25 
 
 		 348 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  41.14 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  41.37 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  41.37 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  41.37 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  43 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  38.99 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  38.36 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  38.36 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  39.53 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  38.1 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  39.8 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  33.66 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  38.82 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  39.12 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  35.16 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  34.52 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  31.43 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  35.23 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  36.42 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  36.04 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  32.35 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  32.35 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.32 
 
 		 766 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  36.63 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  36.63 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  36.63 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  37.75 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  35.71 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  38.71 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  35.48 
 
 		 412 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  38.06 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  30.92 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4573  hypothetical protein  36.18 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  35.67 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  37.09 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  35.97 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  39.61 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  31.6 
 
 		 325 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  29.7 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  36.89 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  31.15 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  33.77 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  37 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  36.36 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  34.84 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  34.54 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  35.11 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  35.76 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>