131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1582 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  58.52 
 
 
325 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  48.77 
 
 
329 aa  321  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  51.11 
 
 
326 aa  319  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  55.52 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  52.54 
 
 
323 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  50.98 
 
 
326 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  53.18 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  53.18 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  53.51 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  50.49 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  53.29 
 
 
339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  48.28 
 
 
326 aa  302  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  53.38 
 
 
330 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  52.04 
 
 
323 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  52.13 
 
 
320 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  49.35 
 
 
321 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  49.83 
 
 
323 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  51.19 
 
 
323 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  47.06 
 
 
334 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  50.32 
 
 
320 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  52.68 
 
 
327 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  49.34 
 
 
325 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  49.32 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  47.59 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  48.84 
 
 
336 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  48.65 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  48.3 
 
 
723 aa  271  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  47.14 
 
 
308 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  46.69 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  48.89 
 
 
337 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  48.89 
 
 
337 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  46.03 
 
 
310 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  48.57 
 
 
337 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  49.01 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  49.34 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  48.25 
 
 
337 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  48.25 
 
 
337 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  44.34 
 
 
324 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  45.16 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  46.69 
 
 
310 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  49.5 
 
 
323 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  48.17 
 
 
324 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  48.17 
 
 
324 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  48.17 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  45.67 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  48.84 
 
 
324 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  49.32 
 
 
328 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  48.16 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  42.81 
 
 
339 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  46.46 
 
 
333 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  46.46 
 
 
333 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  48.16 
 
 
324 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  48.16 
 
 
324 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  44.85 
 
 
412 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  48.1 
 
 
318 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  43.93 
 
 
366 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  42.62 
 
 
373 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  43.2 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  46.03 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  42.3 
 
 
348 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  41.58 
 
 
334 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  41.21 
 
 
318 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  42.76 
 
 
314 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  43.51 
 
 
325 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  42.05 
 
 
321 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  41.64 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  41.91 
 
 
315 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  45.63 
 
 
328 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  41.91 
 
 
315 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  40.27 
 
 
315 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  41.5 
 
 
332 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  38.69 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01881  hypothetical protein  41.85 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  40.85 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  42.81 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  41.54 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  43.41 
 
 
317 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  41.64 
 
 
320 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  40.67 
 
 
766 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  40.92 
 
 
334 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  37.95 
 
 
321 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  36.45 
 
 
324 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  36.1 
 
 
325 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  40.46 
 
 
321 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  40.76 
 
 
341 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  36.73 
 
 
326 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  40.72 
 
 
318 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  41.97 
 
 
330 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  41.69 
 
 
319 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  39.54 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  37.46 
 
 
344 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  39.54 
 
 
326 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  37.46 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0114  hypothetical protein  39.55 
 
 
317 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.161005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  38.28 
 
 
321 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  38.28 
 
 
321 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  38.28 
 
 
321 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  41.42 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>