130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0892 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  100 
 
 		 348 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  96.84 
 
 		 373 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  86.78 
 
 		 366 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  62.58 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  58.06 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  55.76 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  52.03 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  52.65 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  50.34 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  50.33 
 
 		 412 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  52.4 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  51.86 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  50.33 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  49.34 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  46.2 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  43.42 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  44.48 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  48.47 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  44.52 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  43.97 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  44.29 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  44.83 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  44.83 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  43.62 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  43.54 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  43.6 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  42.3 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  42.44 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  43.25 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  43.52 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  46 
 
 		 310 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  45.33 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  43.54 
 
 		 324 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  42.14 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  43.54 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.47 
 
 		 320 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  41.85 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  42.19 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  43.33 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  45.42 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  45 
 
 		 310 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  43.18 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  43.46 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  44.93 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  44.26 
 
 		 337 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  44.59 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  43.65 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  43.65 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  43.92 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  44.41 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  42.91 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  39.41 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  42.12 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  42.12 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  41.04 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  42.91 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  42.91 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  41.31 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  41.31 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  41.31 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  38.91 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  38.91 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  40.26 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  35.37 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  39.2 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  43.91 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  40.28 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  37.33 
 
 		 325 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  38.05 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  41.69 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  41.36 
 
 		 723 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  41.31 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  40.91 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  37.09 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  39.41 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  42.72 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  38.18 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  38.59 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  41.61 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  40.65 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  40.21 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  40.65 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  38.8 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  40.71 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  34.52 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  42.12 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  37.54 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  39.02 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  36.05 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  37.54 
 
 		 766 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0158  hypothetical protein  42.49 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  38.68 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  39.41 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7042  methyltransferase  38.03 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  37.84 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>