131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0941 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  100 
 
 
341 aa  689    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  51.69 
 
 
346 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  44.74 
 
 
337 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  41.12 
 
 
339 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  41.19 
 
 
766 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  42.43 
 
 
324 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  44.55 
 
 
326 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  46.2 
 
 
332 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  44.82 
 
 
321 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  41.9 
 
 
325 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  41.92 
 
 
359 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  43.42 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  44.34 
 
 
324 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  41 
 
 
344 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  41 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  44.84 
 
 
318 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22440  probable methyltransferase  42.53 
 
 
324 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453934  normal  0.739061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  43 
 
 
321 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  41.97 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  39.93 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  42.24 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  42.24 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  42.24 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  41.48 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0685  hypothetical protein  42.04 
 
 
330 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  43.96 
 
 
321 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  43.79 
 
 
324 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  42.11 
 
 
319 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  42.59 
 
 
324 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  42.52 
 
 
320 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  44.03 
 
 
321 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  43.23 
 
 
328 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  42.05 
 
 
322 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  43.24 
 
 
325 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  36.72 
 
 
339 aa  206  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  44.48 
 
 
323 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4694  methyltransferase  44.01 
 
 
333 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.518224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  41.91 
 
 
399 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  41.47 
 
 
320 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  41.14 
 
 
334 aa  205  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  41.25 
 
 
342 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  41.04 
 
 
323 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  41.06 
 
 
320 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5171  methyltransferase  40.84 
 
 
319 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  38.99 
 
 
318 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  37.86 
 
 
318 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  39.55 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  46.23 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  43.65 
 
 
327 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  39.2 
 
 
327 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  40.76 
 
 
348 aa  196  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  40.13 
 
 
308 aa  195  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  43.32 
 
 
337 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  43 
 
 
337 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  41.85 
 
 
325 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  38.16 
 
 
412 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  38.31 
 
 
321 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  40.06 
 
 
323 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  40.71 
 
 
326 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  41.19 
 
 
310 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  42.58 
 
 
339 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  42.67 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  35.6 
 
 
334 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  42.67 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  40.18 
 
 
336 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  41.45 
 
 
325 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  42.35 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  42.22 
 
 
323 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  42.26 
 
 
325 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  42.02 
 
 
324 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  42.02 
 
 
324 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  41.69 
 
 
324 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  42.02 
 
 
337 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6101  methyltransferase  36.62 
 
 
325 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  39.94 
 
 
326 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  42.02 
 
 
337 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  41.1 
 
 
318 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2631  methyltransferase  40.36 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  41.69 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  39.66 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  37.34 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  37.21 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  39.41 
 
 
366 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  41.38 
 
 
333 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  37.85 
 
 
323 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  37.7 
 
 
723 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  41.03 
 
 
333 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  34.21 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  38.32 
 
 
310 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  38.63 
 
 
310 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  38.14 
 
 
329 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  38.96 
 
 
362 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  38.19 
 
 
326 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  37.46 
 
 
334 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0612  methyltransferase  38.73 
 
 
328 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  39.74 
 
 
328 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4447  methyltransferase  35.36 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100935  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  34.7 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  40 
 
 
373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>