131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1610 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  60.93 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  59.93 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  59.6 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  52.79 
 
 		 412 aa  335  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  53.2 
 
 		 362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  53.54 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  50.34 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  50.34 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  51.01 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  52.77 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  46.46 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  49.17 
 
 		 417 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  46.8 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  42.32 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  45.89 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  47.84 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  45.24 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  47.96 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  47.14 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  46.44 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  44.03 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  45.36 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  43.43 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  45.36 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  46.84 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  46.6 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  45.7 
 
 		 337 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  44.03 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  45.7 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  44.33 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  45.7 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  45.36 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  45.7 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  43.23 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  44.78 
 
 		 310 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  43.73 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  45.54 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  43.23 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  42.66 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  43.54 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  45.27 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  44.7 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  43 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  46.1 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  43.45 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  43.38 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  42.23 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  41.67 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  42.14 
 
 		 324 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  43.24 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  41.2 
 
 		 334 aa  225  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  43.14 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  43.2 
 
 		 723 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  43.14 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  42.67 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  44.71 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  38.69 
 
 		 337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  45.13 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  40.2 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  40.47 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  38.8 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  35.62 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  40.94 
 
 		 328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  41.31 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  42.95 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  38.89 
 
 		 766 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  41.64 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  40.68 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  40.54 
 
 		 328 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  36.16 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  35.31 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  39.4 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  39.4 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  40.13 
 
 		 341 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  35.78 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  35.78 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  39.5 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2125  methyltransferase  39.93 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4514  hypothetical protein  39.94 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  39.87 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1148  methyltransferase  36.88 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  40.92 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  39.67 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  39.67 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  39.67 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  40.72 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  33.22 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8031  methyltransferase  39.4 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.754359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  40.26 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  35.67 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  37 
 
 		 321 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7303  hypothetical protein  38.21 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  37.17 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  36.39 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>